Bolsa 11/20720-2 - Biologia computacional, Modelagem molecular - BV FAPESP
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Estudo das interações moleculares entre tioredoxinas/tioredoxinas redutase e inibidores/moduladores alostéricos e caracterização das interações moleculares presentes no sistema Trx

Processo: 11/20720-2
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2011
Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2012
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Ana Lígia Barbour Scott
Beneficiário:Valderes de Conto
Instituição Sede: Centro de Matemática, Computação e Cognição (CMCC). Universidade Federal do ABC (UFABC). Ministério da Educação (Brasil). Santo André , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:11/11857-4 - Estudo das interações moleculares entre tioredoxinas/tioredoxinas redutase e inibidores/moduladores alostéricos e caracterização das interações moleculares presentes no sistema Trx, AP.R
Assunto(s):Biologia computacional   Modelagem molecular   Simulação de dinâmica molecular   Tiorredoxinas   Regulação alostérica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:bioinformática | Dinâmica Molecular | Docking Proteína-Ligante | Docking proteína-proteína | Mutantes | Modelagem Molecular

Resumo

Essa bolsa TT3/40 estará vinculada o auxílio regular solicitado que possui como principais objetivos: - Criar modelos, teóricos, para as Trx e TrxR através de modelagem por homologia, threading e dinâmica molecular, quando necessário; - Calcular os modos normais, de baixa frequência, da Trx e TrxR(TrxR1); - Selecionar os MNs mais significativos e gerar a estruturas da Trx e TrxR a partir dos modos normais, analisando a flexibilidade dessas moléculas; - Simular o docking flexível (usando estruturas obtidas no passo 4) da TrxR com cofatores (NADPH/NADP+, FAD) inibidores/moduladores alostéricos.

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