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Identificação dás espécies dè Fusarium dè amostras clínicas dò Hospital de Clínicas da UNICAMP através dás técnicas dè microarranjo dè DNA e amplificação isotérmica Èm ciclos (LAMP)

Processo: 11/16205-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de março de 2012
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia
Pesquisador responsável:Plinio Trabasso
Beneficiário:Marcela de Souza
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Fusarium   Fungos filamentosos   Fungos

Resumo

Este trabalho tem por objetivo a realização do método de "DNA microarray" para a identificação de fungos filamentosos, agentes de infecção da corrente sanguínea, isolados de pacientes com doenças onco-hematológicas atendidos no Hospital de Clínicas (HC) da UNICAMP. Os casos serão selecionados a partir de pacientes da enfermaria de hematologia do HC-UNICAMP, que atende prioritariamente pacientes com leucemias agudas e linfomas de Hodgkin e não Hodgkin, com suspeita de fungemia. As cepas de fungos filamentosos serão previamente isoladas a partir dos exames de rotina desses pacientes, realizados no Setor de Micologia do Laboratório de Microbiologia do HC-UNICAMP. Os isolados serão identificados, utilizando a combinação de características macroscópicas e micromorfológicas, e serão subcultivados e submetidos à Análise em Plataforma de Sequências de Oligonucleotídeos (DNA-microarray). A plataforma será desenvolvida na Universidade Estadual de Campinas, baseada em sequêncais de oligonucleotídeos previamente definidas e plotadas em lâmina de plásticos para os fungos filamentosos mais frequentes nesta população, a saber: Fusarium complexo solani, Fusarium oxysporum, Fusarium moniliforme, Fusarium sacchari, Fusarium glicynes, Fusarium delphinoides, Fusarium napiforme, Fusarium falciforme, Aspergillus sp, Rhizopus, Rhizomucor, Mucor, Scedosporium, Exophiala, Absidia, Cladosporium.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DE SOUZA, MARCELA; MATSUZAWA, TETSUHIRO; SAKAI, KANAE; MURAOSA, YASUNORI; LYRA, LUZIA; BUSSO-LOPES, ARIANE FIDELIS; SHAFFERMAN LEVIN, ANNA SARA; SCHREIBER, ANGELICA ZANINELLI; MIKAMI, YUZURU; GONOI, TOHORU; KAMEI, KATSUHIKO; MORETTI, MARIA LUIZA; TRABASSO, PLINIO. Comparison of DNA Microarray, Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) and Real-Time PCR with DNA Sequencing for Identification of Fusarium spp. Obtained from Patients with Hematologic Malignancies. Mycopathologia, v. 182, n. 7-8, p. 625-632, AUG 2017. Citações Web of Science: 2.
DE SOUZA, MARCELA; MATSUZAWA, TETSUHIRO; LYRA, LUZIA; BUSSO-LOPES, ARIANE FIDELIS; GONOI, TOHRU; SCHREIBER, ANGELICA ZANINELE; KAMEI, KATSUHIKO; MORETTI, MARIA LUIZA; TRABASSO, PLINIO. Fusarium napiforme systemic infection: case report with molecular characterization and antifungal susceptibility tests. SPRINGERPLUS, v. 3, AUG 30 2014. Citações Web of Science: 9.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
SOUZA, Marcela de. Comparação de técnicas moleculares para identificação das espécies de fusarium de amostras clínicas. 2014. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Faculdade de Ciências Médicas.

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