Análise do perfil de expressão de microRNAs e sua associação com resposta a drogas quimioterápicas em linhagens celulares de tumor de cólon

• Processo: 11/19645-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de março de 2012
• Vigência (Término): 31 de agosto de 2015
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Anamaria Aranha Camargo
• Beneficiário: Gustavo Starvaggi França
• Instituição Sede: Laboratório de Biologia Molecular e Genômica. Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer (ILPC). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Neoplasias MicroRNAs Expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: câncer | drogas anti-tumorais | expressão gênica | MicroRNAs | Genômica, Bioinformática

Resumo

O câncer colorretal está entre as três maiores causas de morte por câncer no mundo. O seu diagnóstico é feito por meio de análises histopatológicas, que definem o grau de estadiamento da doença. O tratamento é conduzido conforme o estadiamento observado. Para os casos mais avançados (estadios III e IV), recomenda-se a ressecção cirúrgica associada à terapia adjuvante, na qual se faz uso de diferentes drogas quimioterápicas. Contudo, o câncer colorretal é uma doença de alta heterogeneidade genética. A resposta clínica dos pacientes submetidos à terapia adjuvante é extremamente variável, o que torna mais problemático delinear o tratamento adequado. Por isso, é essencialmente importante compreender os mecanismos envolvidos com a quimioresistência e a progressão tumoral, de forma que o diagnóstico e o tratamento possam ser mais efetivos e personalizados.Os microRNAs são RNAs não codificantes que atuam na regulação de diversos processos celulares. Inúmeros estudos têm mostrado que alterações nos níveis de expressão de microRNAs influenciam diretamente os processos de quimioresistência e tumorigênese, servindo inclusive como marcadores de diagnóstico. Considerando o potencial dos microRNAs como reguladores da expressão gênica, este projeto tem como proposta investigar, através do sequenciamento de segunda geração e métodos computacionais, o perfil de expressão de microRNAs e sua associação com a resposta ao tratamento com diferentes drogas quimioterápicas previamente testadas em linhagens celulares de tumor de cólon. Para isso, serão desenvolvidos métodos para a identificação de microRNAs conhecidos e possivelmente caracterizar novos microRNAs. Também serão investigados os genes alvo dos microRNAs, tendo como objetivo desvendar mecanismos de regulação envolvidos com a resistência e sensibilidade a compostos anti-tumorais e fatores que atuam na tumorigênese do câncer de cólon. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

HINSKE, LUDWIG CHRISTIAN; FRANCA, GUSTAVO S.; TORRES, HUGO A. M.; OHARA, DANIEL T.; LOPES-RAMOS, CAMILA M.; HEYN, JENS; REIS, LUIZ F. L.; OHNO-MACHADO, LUCILA; KRETH, SIMONE; GALANTE, PEDRO A. F.. miRIAD-integrating microRNA inter- and intragenic data. DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATION, OCT 6 2014. (11/19645-6)

HINSKE, LUDWIG CHRISTIAN; FRANCA, GUSTAVO S.; TORRES, HUGO A. M.; OHARA, DANIEL T.; LOPES-RAMOS, CAMILA M.; HEYN, JENS; REIS, LUIZ F. L.; OHNO-MACHADO, LUCILA; KRETH, SIMONE; GALANTE, PEDRO A. F.. miRIAD-integrating microRNA inter- and intragenic data. DATABASE-THE JOURNAL OF BIOLOGICAL DATABASES AND CURATION, v. N/A, p. 9-pg., 2014-10-06. (11/19645-6)

FRANCA, GUSTAVO S.; VIBRANOVSKI, MARIA D.; GALANTE, PEDRO A. F.. Host gene constraints and genomic context impact the expression and evolution of human microRNAs. NATURE COMMUNICATIONS, v. 7, APR 2016. (11/19645-6)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

FRANÇA, Gustavo Starvaggi. Estudos sobre a organização genômica, evolução e expressão de microRNAs. 2015. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Conjunto das Químicas (IQ e FCF) (CQ/DBDCQ) São Paulo.