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Homólogos a At-thi1 em cana-de-açúcar: estudo molecular e funcional

Processo: 12/02671-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de março de 2012
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Marie-Anne van Sluys
Beneficiário:Andréia Prata Vieira
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/52074-0 - Sugarcane genome sequence: plant transposable elements are active contributors to gene structure variation, regulation and function, AP.BIOEN.TEM
Assunto(s):Genética molecular vegetal   Genômica   Expressão gênica   Cana-de-açúcar   Leveduras   Metabolismo energético

Resumo

A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é uma monocotiledônea de metabolismo C4, que apresenta grande acúmulo de sacarose no colmo. Trata-se de uma importante cultura tropical cultivada para a obtenção de açúcar e, mais recentemente, do biocombustível etanol, entre outros produtos. Apesar de sua importância econômica, pouco ainda se conhece sobre a estrutura do seu genoma. Sabe-se que os cultivares modernos são híbridos interespecíficos que apresentam um genoma altamente complexo. O programa SUCEST (Sugarcane EST Project - Vettore et al., 2003) produziu sequências do transcriptoma dessa planta, de forma a iniciar o estudo das regiões codificantes. A partir do banco de reads do SUCEST, dois SAS (Sugarcane Assembled Sequences), denominados SAS1_SC-THI1 e SAS2_sc-thi1, foram identificados como possíveis homólogos do gene thi1 de Arabdopsis thaliana e thi4 de Saccharomices cerevisiae. Esses genes estão envolvidos na biossíntese do anel tiazol, um dos componentes da tiamina (vitamina B1) necessária ao funcionamento energético das células, sendo cofator para enzimas que atuam em diversas vias metabólicas. Enquanto A. thaliana e outras espécies vegetais apresentam apenas uma cópia deste gene, cana apresenta pelo menos duas cópias, assim como outras gramíneas C4. Resultados anteriores do nosso grupo observaram que o mutante tz-201 de A. thaliana, apresenta acúmulo de sacarose nos tecidos. Esses resultados, juntamente com a existência de dois transcritos com perfil de expressão distintos no SUCEST, tornam interessante a averiguação da função dos homólogos de cana-de-açúcar. Assim, o presente projeto tem como objetivo estudar a função desses dois possíveis genes através de análises de expressão, estudo de complementação em mutante de levedura THI4, além da caracterização do contexto genômico dos genes em cana-de-açúcar. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
OCHOA CRUZ, EDGAR ANDRES; QUEIROGA CRUZ, GUILHERME MARCELLO; VIEIRA, ANDREIA PRATA; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Virus-like attachment sites as structural landmarks of plants retrotransposons. MOBILE DNA, v. 7, JUL 28 2016. Citações Web of Science: 0.
CRUZ, GUILHERME M. Q.; METCALFE, CUSHLA J.; DE SETTA, NATHALIA; CRUZ, EDGAR A. O.; VIEIRA, ANDREIA PRATA; MEDINA, ROSARIO; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Virus-Like Attachment Sites and Plastic CpG Islands: Landmarks of Diversity in Plant Del Retrotransposons. PLoS One, v. 9, n. 5 MAY 21 2014. Citações Web of Science: 2.

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