| Processo: | 12/00316-5 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de junho de 2012 |
| Data de Término da vigência: | 31 de maio de 2014 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Quantitativa |
| Pesquisador responsável: | José Eduardo Krieger |
| Beneficiário: | Nubia Esteban Duarte |
| Instituição Sede: | Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
| Assunto(s): | Mapeamento genético Análise multivariada |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | análise multivariada | Análises haplotípicas | Dados de Famílias | Mapeamento genético | Plataformas de SNPs | Genética Quantitativa |
Resumo Atualmente, um dos problemas mais importantes da Genética é a identificação de genes associados com doenças complexas. Um delineamento adequado para esta finalidade corresponde à coleta de dados de famílias e plataformas de marcadores moleculares do tipo SNP (do inglês, Single Nucleotide Polimorphism). Estas plataformas representam uma amostra do genoma de alta dimensão e as técnicas de análises para este tipo de marcadores, quando combinados com dados de família, traz desafios na aplicação de metodologias estatísticas específicas de análise. Destaca-se o problema de múltiplos testes e de difícil detecção de significância de efeito individual de SNP, dado que, em geral, este é pequeno e não gera covariância entre indivíduos.No intuito de selecionar SNPs e estudar seu efeito individual, o modelo misto poligênico tem sido utilizado. Contudo, uma estratégia alternativa é mensurar o efeito simultâneo de conjuntos ordenados de SNPs (haplótipo) e não de SNPs individuais. Neste contexto, a teoria associada ao Gráfico da Variável Adicionada (Hilden Minton, 1995) é relevante já que permite decompor o efeito do SNP em componentes associados a famílias (poligênico) e à população geral (resíduos). Esta teoria tem sido desenvolvida em Duarte (2011) para o caso em que é adicionado ao modelo misto um SNP por vez e sob diferentes cenários de dados simulados. Neste projeto serão realizadas aplicações desta metodologia considerando dados reais e estendendo o estudo para a inclusão de interação entre SNPs (epistasia). Ainda, o modelo proposto será generalizado para situações multivariadas no intuito de encontrar genes que influenciam mais do que um fenótipo (pleiotropia).A motivação para o presente projeto é a análise dos dados que estão sendo coletados no Projeto `` Corações de Baependi" (Processo Fapesp2007/58150-7). | |
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