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Evolução e filodinâmica dos recombinantes BF de HIV-1 da América do Sul

Processo: 12/04818-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2012
Vigência (Término): 30 de novembro de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Paolo Marinho de Andrade Zanotto
Beneficiário:Atila Iamarino
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):13/15144-8 - Evolução genômica de grandes vírus de DNA de insetos, BE.EP.PD
Assunto(s):Evolução molecular   HIV-1

Resumo

Recombinantes BF de HIV-1 possuem um importante papel na epidemia de AIDS da América do Sul, em especial no Brasil e Argentina, e são reconhecidos pelo seu rápido espalhamento e capacidade replicativa. Ao contrário de outras epidemias com formas circulantes recombinantes bem estabelecidas, os recombinantes BF da América do Sul são compostos por múltiplas formas recombinantes únicas, resultantes de diferentes eventos de recombinação, embora possam ser erroneamente agrupados com base no perfil de recombinação. A recombinação é um processo evolutivo importante para o HIV-1, capaz de aumentar o fitness viral, permitir o escape da resposta imune e gerar variantes resistentes à terapia anti-retroviral, e pode ter grandes consequências epidêmicas em locais como Brasil e Argentina, onde há extensa prevalência de terapia. Este trabalho visa reavaliar a classificação e o número de formas recombinantes BF entre todas as sequências de HIV-1 da América do Sul disponíveis, bem como estimar parâmetros populacionais e evolutivos que permitam o entendimento do crescimento e do papel dos recombinantes BF na epidemia desta região. Serão avaliados também a relação de ancestralidade entre fragmentos comuns a diversos recombinantes e a pressão seletiva atuante sobre regiões recorrentes, descrevendo possíveis alvos de terapêuticos.

Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (2 total):
Folha de S. Paulo: Cientistas mapeiam vírus em morcegos em ação contra novas epidemias (08/Mai/2020)
Folha.com: Cientistas mapeiam coronavírus em morcegos em ação contra novas epidemias (06/Mai/2020)

Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DE MELO FREIRE, CAIO CESAR; PALMISANO, GIUSEPPE; BRACONI, CARLA T.; CUGOLA, FERNANDA R.; RUSSO, FABIELE B.; BELTRAO-BRAGES, PATRICIA C. B.; LAMARINO, ATILA; DE LIMA NETO, DANIEL FERREIRA; SALL, AMADOU ALPHA; ROSA-FERNANDES, LIVIA; LARSEN, MARTIN R.; DE ANDRADE ZANOTTO, PAOLO MARINHO. NS1 codon usage adaptation to humans in pandemic Zika virus. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 113, n. 5, p. -, 2018. Citações Web of Science: 2.
ZHAO, ZI-MING; ZHAO, BIXIAO; BAI, YALAI; IAMARINO, ATILA; GAFFNEY, STEPHEN G.; SCHLESSINGER, JOSEPH; LIFTON, RICHARD P.; RIMM, DAVID L.; TOWNSEND, JEFFREY P. Early and multiple origins of metastatic lineages within primary tumors. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v. 113, n. 8, p. 2140-2145, FEB 23 2016. Citações Web of Science: 45.
FREIRE, CAIO C. M.; IAMARINO, ATILA; LY SOUMARE, PEINDA O.; FAYE, OUSMANE; SALL, AMADOU A.; ZANOTTO, PAOLO M. A. Reassortment and distinct evolutionary dynamics of Rift Valley Fever virus genomic segments. SCIENTIFIC REPORTS, v. 5, JUN 23 2015. Citações Web of Science: 9.
FAYE, OUMAR; FREIRE, CAIO C. M.; IAMARINO, ATILA; FAYE, OUSMANE; DE OLIVEIRA, JULIANA VELASCO C.; DIALLO, MAWLOUTH; ZANOTTO, PAOLO M. A.; SALL, AMADOU ALPHA. Molecular Evolution of Zika Virus during Its Emergence in the 20th Century. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 8, n. 1 JAN 2014. Citações Web of Science: 373.

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