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Evolução e filodinâmica dos recombinantes BF de HIV-1 da América do Sul

Processo: 12/04818-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2012
Vigência (Término): 30 de novembro de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Paolo Marinho de Andrade Zanotto
Beneficiário:Atila Iamarino
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):13/15144-8 - Evolução genômica de grandes vírus de DNA de insetos, BE.EP.PD
Assunto(s):HIV-1

Resumo

Recombinantes BF de HIV-1 possuem um importante papel na epidemia de AIDS da Américado Sul, em especial no Brasil e Argentina, e são reconhecidos pelo seu rápido espalhamento ecapacidade replicativa. Ao contrário de outras epidemias com formas circulantes recombinantesbem estabelecidas, os recombinantes BF da América do Sul são compostos por múltiplas formasrecombinantes únicas, resultantes de diferentes eventos de recombinação, embora possam sererroneamente agrupados com base no perfil de recombinação. A recombinação é um processoevolutivo importante para o HIV-1, capaz de aumentar o fitness viral, permitir o escape da respostaimune e gerar variantes resistentes à terapia anti-retroviral, e pode ter grandes consequênciasepidêmicas em locais como Brasil e Argentina, onde há extensa prevalência de terapia. Estetrabalho visa reavaliar a classificação e o número de formas recombinantes BF entre todas assequências de HIV-1 da América do Sul disponíveis, bem como estimar parâmetros populacionais eevolutivos que permitam o entendimento do crescimento e do papel dos recombinantes BF naepidemia desta região. Serão avaliados também a relação de ancestralidade entre fragmentoscomuns a diversos recombinantes e a pressão seletiva atuante sobre regiões recorrentes,descrevendo possíveis alvos de terapêuticos.

Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DE MELO FREIRE, CAIO CESAR; PALMISANO, GIUSEPPE; BRACONI, CARLA T.; CUGOLA, FERNANDA R.; RUSSO, FABIELE B.; BELTRAO-BRAGES, PATRICIA C. B.; LAMARINO, ATILA; DE LIMA NETO, DANIEL FERREIRA; SALL, AMADOU ALPHA; ROSA-FERNANDES, LIVIA; LARSEN, MARTIN R.; DE ANDRADE ZANOTTO, PAOLO MARINHO. NS1 codon usage adaptation to humans in pandemic Zika virus. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 113, n. 5, p. -, 2018. Citações Web of Science: 0.
ZHAO, ZI-MING; ZHAO, BIXIAO; BAI, YALAI; IAMARINO, ATILA; GAFFNEY, STEPHEN G.; SCHLESSINGER, JOSEPH; LIFTON, RICHARD P.; RIMM, DAVID L.; TOWNSEND, JEFFREY P. Early and multiple origins of metastatic lineages within primary tumors. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v. 113, n. 8, p. 2140-2145, FEB 23 2016. Citações Web of Science: 45.
FREIRE, CAIO C. M.; IAMARINO, ATILA; LY SOUMARE, PEINDA O.; FAYE, OUSMANE; SALL, AMADOU A.; ZANOTTO, PAOLO M. A. Reassortment and distinct evolutionary dynamics of Rift Valley Fever virus genomic segments. SCIENTIFIC REPORTS, v. 5, JUN 23 2015. Citações Web of Science: 9.
FAYE, OUMAR; FREIRE, CAIO C. M.; IAMARINO, ATILA; FAYE, OUSMANE; DE OLIVEIRA, JULIANA VELASCO C.; DIALLO, MAWLOUTH; ZANOTTO, PAOLO M. A.; SALL, AMADOU ALPHA. Molecular Evolution of Zika Virus during Its Emergence in the 20th Century. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 8, n. 1 JAN 2014. Citações Web of Science: 375.

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