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Desenvolvimento de bancos de dados e ferramentas de genômica comparativa

Processo: 12/06724-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de agosto de 2012
Vigência (Término): 30 de setembro de 2012
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Carlos Frederico Martins Menck
Beneficiário:Huma Asif
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:09/52417-7 - Respostas celulares a lesões no genoma, AP.TEM
Assunto(s):Biologia computacional   Caulobacter crescentus   Filogenia   Banco de dados   Transferência genética horizontal

Resumo

Esta proposta prevê o desenvolvimento de uma melhoria na estrutura de bioinformática deste laboratório, com criação de bancos de dados e ferramentas de análise desses dados. Por um lado, pretendemos que seja desenvolvido um banco de dados que centralize e facilite a gestão das informações obtidas na análise de mutantes da bactéria Caulobacter crescentus. Por outro, pretendemos criar uma ferramenta amigável de genômica comparativa que permita a busca de genes comuns ou ausentes em genomas de determinados grupos bacterianos. (AU)