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Identificação e caracterização de genes associados à deposição e composição da gordura intramuscular em bovinos da raça Nelore

Processo: 12/02383-1
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Vigência (Início): 01 de junho de 2012
Vigência (Término): 31 de maio de 2013
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Luiz Lehmann Coutinho
Beneficiário:Aline Silva Mello Cesar
Supervisor no Exterior: James M. Reecy
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Local de pesquisa : Iowa State University, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:11/00005-7 - Identificação de genes associados à deposição e composição da gordura intramuscular em bovinos da raça Nelore, BP.DR
Assunto(s):Expressão gênica

Resumo

A deposição e composição da gordura são determinadas por muitos genes que participam direta ou indiretamente da adipogênese e do metabolismo lipídico. A seleção de animais com teor e composição de gordura adequado para o consumidor é complexa pela difícil mensuração destas características, pela moderada herdabilidade e pelo desconhecimento dos genes envolvidos. Na última década, presenciamos um grande avanço na área da genômica bovina que resultou no seqüenciamento completo do genoma e no desenvolvimento de chips de alta densidade de SNP. Este projeto tem como objetivo identificar genes e variantes alélicas associadas com a porcentagem e composição da gordura intramuscular (GIM) em bovinos Nelore. Estão sendo utilizados 457 Nelores para a avaliação do teor de lipídeos total do músculo Longissimus dorsi (LD), genotipagem com chip de alta densidade de SNPs (Illumina SNP800 BeadChip), perfil de ácidos graxos e estudo de associação de SNPs para encontrar genes por posição associados às características fenotípicas de interesse. Para o estudo de expressão gênica serão utilizados 36 animais com valores extremos para porcentagem de GIM. Para este fim serão utilizadas as estratégias de associação genômica (genome wide association studies, GWAS), seqüenciamento de RNA mensageiro(RNA-seq) e integração dos resultados por bioinformática. Para a integralização de todos os dados gerados é necessária uma plataforma de análises de dados de bioinformática estruturada e operante, o que ainda não se encontra no Brasil por ser uma área em desenvolvimento. Para a devida conclusão e análise da grande quantidade de dados deste projeto solicita-se a bolsa estágio de pesquisa no exterior (BEPE) à estudante executora deste projeto no Departamento de Ciência Animal da Universidade Estadual de Iowa/USA sob orientação do pesquisador Dr. James Reecy coordenador do Programa de Bioinformática de sua universidade. Atualmente, Dr. Reecy trabalha na área de genômica animal com os objetivos gerais de identificar formas de aumentar a produção de tecido magro e qualidade da carne de gado e desenvolver ferramentas de bioinformática para pesquisa genômica. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CESAR, ALINE S. M.; REGITANO, LUCIANA C. A.; KOLTES, JAMES E.; FRITZ-WATERS, ERIC R.; LANNA, DANTE P. D.; GASPARIN, GUSTAVO; MOURAO, GERSON B.; OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; REECY, JAMES M.; COUTINHO, LUIZ L. Putative Regulatory Factors Associated with Intramuscular Fat Content. PLoS One, v. 10, n. 6 JUN 4 2015. Citações Web of Science: 27.
CESAR, ALINE S. M.; REGITANO, LUCIANA C. A.; MOURAO, GERSON B.; TULLIO, RYMER R.; LANNA, DANTE P. D.; NASSU, RENATA T.; MUDADO, MAURICIO A.; OLIVEIRA, PRISCILA S. N.; DO NASCIMENTO, MICHELE L.; CHAVES, AMALIA S.; ALENCAR, MAURICIO M.; SONSTEGARD, TAD S.; GARRICK, DORIAN J.; REECY, JAMES M.; COUTINHO, LUIZ L. Genome-wide association study for intramuscular fat deposition and composition in Nellore cattle. BMC GENETICS, v. 15, MAR 25 2014. Citações Web of Science: 43.

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