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Seqüenciamento de última geração de RNAm para análise em larga escala da expressão gênica durante a metamorfose das castas de Apis mellifera

Processo: 12/12941-1
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de outubro de 2012
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Marcia Maria Gentile Bitondi
Beneficiário:Michelle Prioli Miranda Soares
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:11/03171-5 - Análise causal do desenvolvimento de Apis mellifera - genes reguladores e redes hierárquicas de expressão gênica na especificação de tecidos e órgãos, AP.TEM
Assunto(s):Transcriptoma   Análise de sequência de RNA   Metamorfose   Apis mellifica

Resumo

A metamorfose dos insetos consiste na transformação de um organismo imaturo em uma forma sexualmente madura, e se caracteriza pela degeneração ou remodelação dos tecidos larvais, enquanto os tecidos dos adultos são formados e se diferenciam a partir de células precursoras localizadas em diferentes regiões do corpo da larva. De nosso conhecimento, análises em grande escala da expressão gênica durante a metamorfose foram realizadas somente em Drosophila utilizando-se microarrays de sequências de cDNA que representaram 30-40% do total de genes preditos do genoma deste inseto-modelo. Estamos propondo aqui uma análise mais abrangente da variação da expressão gênica durante a metamorfose da abelha social Apis mellifera e para isto, utilizaremos da metodologia RNA seq (high-throughput RNA sequencing) para sequenciamento do transcriptoma. Esta análise global tem por finalidade o screening de genes diferencialmente expressos durante etapas precisas da metamorfose. Permitirá ainda, com o auxílio de ferramentas de bioinformática: (1) agrupar estes genes em classes de acordo com potenciais funções, (2) proceder à busca de sítios comuns nas regiões promotoras, passíveis de regulação por fatores de transcrição ou hormônios, que indiquem redes de co-regulação, (3) estabelecer redes hierárquicas de expressão gênica atuantes na metamorfose. Mais ainda, propomos a utilização de operárias e rainhas neste tipo de abordagem, com a finalidade de investigar peculiaridades casta-específicas da atividade gênica durante a transformação da larva em adulto. Espera-se que esta abordagem revele o amplo panorama da genética molecular da metamorfose.