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Biodiversidade de Selenastraceae (microalgas clorococáceas de água doce): características morfológicas, e sequenciamento do 18S rDNA como base taxonômica tradicional para a obtenção do DNA-barcode

Processo: 12/19520-1
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de novembro de 2012
Vigência (Término): 29 de fevereiro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Botânica - Taxonomia Vegetal
Pesquisador responsável:Armando Augusto Henriques Vieira
Beneficiário:Thaís Garcia da Silva
Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:11/50054-4 - Biodiversidade de microalgas de água doce: banco de germoplasma e obtenção de marcadores moleculares das espécies criopreservadas, AP.BTA.TEM
Bolsa(s) vinculada(s):13/17457-3 - Taxonomia tradicional e análise das sequências do 18S rDNA, ITS2 e rbcL de espécies de microalgas de água doce da família Selenastraceae, BE.EP.DD
Assunto(s):Botânica (classificação)   Biologia molecular
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Biologia molecular | DNA barcode | Selenastraceae | taxonomia classica | Genética molecular e de microorganismos

Resumo

Este projeto propõe a utilização de práticas da taxonomia tradicional e análise do sequenciamento do 18S rDNA de espécies de microalgas verde de água doce da família Selenastraceae. O objetivo principal é fornecer uma base taxonômica para a identificação da biodiversidade desses organismos atualmente dispersos no "complexo" Ankistrodesmaceae/ Selenastraceae/ Chlorellaceae/ Oocystaceae, grupo taxonomicamente problemático. Para a resolução ao nível de espécie, a obtenção de DNA-barcode é uma poderosa ferramenta, mas não prescinde das práticas da taxonomia tradicional: morfologia, quimiotaxonomia, e outras informações colaterais (Hajibabaei et al., 2007). Organismos devem estar inseridos em um sistema taxonômico confiável ainda que, em alguns grupos, não o suficiente para a diferenciação específica sem margens a erros (como é caso das microalgas com suas altas taxas de convergência morfológica, polimorfismo e a alta incidência de espécies crípticas). Nestes casos, o DNA-barcode associado às práticas da taxonomia tradicional poderá ser o fator definitivo na identificação correta das espécies. Uma base taxonômica relativamente sólida, baseada em caracteres morfológicos, análise filogenética pelo 18S rDNA e perfis bioquímicos específicos é um ótimo ponto de partida para o fornecimento de "vouchers" para a obtenção do DNA-barcodes. Nas microalgas clorococáceas, ainda que subjetivas, as características morfológicas são extremamente necessárias e úteis para funcionarem como ponto de partida e, em muitos casos, são até determinantes na diferenciação (Fawley et al., 2005). Entretanto, frequentemente as diferenças morfológicas entre as espécies só são detectáveis através dos cultivos, e por isso as espécies a serem utilizadas neste trabalho serão cultivadas e amostradas nas diferentes fases do crescimento específico. (AU)

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Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GARCIA, T. S.; BOCK, CHRISTINA; BAGATINI, INESSA LACATIVA; ARCHANJO, NAIARA CAROLINA PEREIRA; SANT'ANNA, CELIA LEITE; VIEIRA, ARMANDO AUGUSTO HENRIQUES. Hidden diversity in Selenastraceae (Sphaeropleales, Chlorophyceae): Molecular phylogeny revealed a nannoplanktonic species, with the description of Viridiparva madeirensis gen. et sp. nov.. ALGAL RESEARCH-BIOMASS BIOFUELS AND BIOPRODUCTS, v. 68, p. 9-pg., . (11/50054-4, 13/17457-3, 12/19520-1, 19/03177-5, 13/18083-0, 16/07089-5)
BAGATINI, INESSA LACATIVA; MECCHERI, FABRICIO SEBASTIANI; PAULSEN, BERIT SMESTED; DA SILVA, THAIS GARCIA; BARSETT, HILDE; HENRIQUES VIEIRA, ARMANDO AUGUSTO. Diversity of monosaccharides and glycosidic linkages on extracellular polysaccharides of the microalga Ankistrodesmus (Chlorophyceae). PHYCOLOGIA, v. N/A, p. 12-pg., . (13/18083-0, 19/03177-5, 13/17457-3, 12/19520-1, 12/00221-4, 11/50054-4)
DA SILVA, THAIS GARCIA; BOCK, CHRISTINA; SANT'ANNA, CELIA LEITE; BAGATINI, INESSA LACATIVA; WODNIOK, SABINA; HENRIQUES VIEIRA, ARMANDO AUGUSTO. Selenastraceae (Sphaeropleales, Chlorophyceae): rbcL, 18S rDNA and ITS-2 secondary structure enlightens traditional taxonomy, with description of two new genera, Messastrum gen. nov. and Curvastrum gen. nov.. Fottea, v. 17, n. 1, p. 1-19, . (12/19520-1, 13/17457-3, 11/50054-4, 13/18083-0)
MORI, CILENE CRISTINA; BAGATINI, INESSA LACATIVA; DA SILVA, THAIS GARCIA; PARRISH, CHRISTOPHER CHARLES; HENRIQUES VIEIRA, ARMANDO AUGUSTO. Use of fatty acids in the chemotaxonomy of the family Selenastraceae (Sphaeropleales, Chlorophyceae). Phytochemistry, v. 151, p. 9-16, . (13/03979-8, 11/50054-4, 12/19520-1, 13/18083-0)

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