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Cariótipo molecular e evolução cromossômica em Trypanosoma cruzi: Análise sintênica entre isolados de diferentes linhagens do parasita

Processo: 12/21713-2
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de dezembro de 2012
Vigência (Término): 30 de novembro de 2013
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
Pesquisador responsável:José Franco da Silveira Filho
Beneficiário:Caroline Cortez
Instituição-sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:11/51475-3 - Biologia molecular e celular do parasitismo por Trypanosoma cruzi, AP.TEM
Assunto(s):Cromossomos   Eletroforese em gel de campo pulsado   Evolução cromossômica   Trypanosoma cruzi

Resumo

No presente projeto, o cariótipo molecular de diferentes isolados de Trypanosoma cruzi, obtido por eletroforese de campo pulsado, será correlacionado com os mapas físico e genético pela hibridização com marcadores cromossomo- específicos identificados nos bancos de dados do genoma de T. cruzi. Recentemente, nós comparamos o padrão de hibridização de 120 marcadores cromossomo- específicos identificados in silico com as bandas cromossômicas separadas por PFGE do clone CL Brener e da cepa G. Esta análise mostrou que grandes blocos sintênicos são conservados entre os isolados, porém há quebra de sintenia devido à duplicação e/ou deleção, que também foram observados.Não sabemos se a preservação da sintenia foi acompanhada pela manutenção da colinearidade gênica em um fenômeno conhecido como mesosintenia.O objetivo do presente projeto é estender a análise sintênica para diferentes isolados T.cruzi ao nível cromossômico por hibridização das bandas cromossômicas com marcadores cromossomos-específico. Serão incluídos nesta análise os genes de 3 clones de T.cruzi que tiveram o genoma recentemente sequenciados (Sylvio X10.1, Dm28c e CL14) e 2 cepas das linhagens Tc III e Tc IV, pouco estudados do ponto de vista cromossômico. A inclusão de isolados sequenciados deverá auxiliar-nos a investigar a ocorrência da mesosintenia em Trypanosoma cruzi.