Análise estrutural e funcional dos transcritos do DNA não-codificante BncDNA associado à presença de cromossomos B em Astatotilapia latifasciata

• Processo: 12/20959-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: César Martins
• Beneficiário: Érica Ramos
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 13/01688-6 - Análise dos transcritos do RNA não-codificante BncDNA associado à presença de cromossomos B em Astatotilapia latifasciata, BE.EP.IC
• Assunto(s): Citogenética Cromossomos B Astatotilapia latifasciata Evolução molecular Evolução animal
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Citogenética | Cromossomo B | DNA repetitivo | Evolução | RNA não-codificante | citogenética

Resumo

Cromossomos B estão presentes em 15% das espécies de Eucariotos e, apesar de serem considerados elementos dispensáveis e parasitas do genoma, alguns estudos têm proposto uma importância funcional relevante a esses cromossomos. Dentre as espécies que possuem cromossomos supernumerários, Astatotilapia latifasciata é um ciclídeo africano que possui de 1 a 2 cromossomos B em aproximadamente 30% dos indivíduos. Nesta espécie foi encontrada uma sequência de DNA repetitivo espalhado por todo o cromossomo B que possui regiões de identidade com sequências dos genomas e transcriptomas das espécies de ciclídeos Metriaclima zebra, Astatotilapia burtoni e Oreochromis niloticus. Esta sequência de DNA não apresentou similaridade a nenhum tipo de elemento repetitivo ou sequência codificante de proteína já conhecidos, sugerindo tratar-se de uma sequência que está sendo transcrita em RNA não-codificante, denominada de BncDNA. Para melhor entendimento da evolução e função dessa sequência no genoma de A. latifasciata, o presente estudo pretende analisar a organização, distribuição e nível de transcrição dessa sequência em diferentes tecidos de indivíduos portadores e não portadores deste cromossomo. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

RAMOS, ERICA; CARDOSO, ADAUTO L.; BROWN, JUDITH; MARQUES, DIEGO F.; FANTINATTI, BRUNO E. A.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; OLIVEIRA, ROGERIO A.; O'NEILL, RACHEL J.; MARTINS, CESAR. The repetitive DNA element BncDNA, enriched in the B chromosome of the cichlid fish Astatotilapia latifasciata, transcribes a potentially noncoding RNA. CHROMOSOMA, v. 126, n. 2, p. 313-323, MAR 2017. (12/20959-8, 10/17212-2, 13/04533-3)