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Análise estrutural e funcional dos transcritos do DNA não-codificante BncDNA associado à presença de cromossomos B em Astatotilapia latifasciata

Processo: 12/20959-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2013
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2013
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:César Martins
Beneficiário:Érica Ramos
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):13/01688-6 - Análise dos transcritos do RNA não-codificante BncDNA associado à presença de cromossomos B em Astatotilapia latifasciata, BE.EP.IC
Assunto(s):Citogenética   Cromossomos B   Astatotilapia latifasciata   Evolução molecular   Evolução animal

Resumo

Cromossomos B estão presentes em 15% das espécies de Eucariotos e, apesar de serem considerados elementos dispensáveis e parasitas do genoma, alguns estudos têm proposto uma importância funcional relevante a esses cromossomos. Dentre as espécies que possuem cromossomos supernumerários, Astatotilapia latifasciata é um ciclídeo africano que possui de 1 a 2 cromossomos B em aproximadamente 30% dos indivíduos. Nesta espécie foi encontrada uma sequência de DNA repetitivo espalhado por todo o cromossomo B que possui regiões de identidade com sequências dos genomas e transcriptomas das espécies de ciclídeos Metriaclima zebra, Astatotilapia burtoni e Oreochromis niloticus. Esta sequência de DNA não apresentou similaridade a nenhum tipo de elemento repetitivo ou sequência codificante de proteína já conhecidos, sugerindo tratar-se de uma sequência que está sendo transcrita em RNA não-codificante, denominada de BncDNA. Para melhor entendimento da evolução e função dessa sequência no genoma de A. latifasciata, o presente estudo pretende analisar a organização, distribuição e nível de transcrição dessa sequência em diferentes tecidos de indivíduos portadores e não portadores deste cromossomo. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
RAMOS, ERICA; CARDOSO, ADAUTO L.; BROWN, JUDITH; MARQUES, DIEGO F.; FANTINATTI, BRUNO E. A.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; OLIVEIRA, ROGERIO A.; O'NEILL, RACHEL J.; MARTINS, CESAR. The repetitive DNA element BncDNA, enriched in the B chromosome of the cichlid fish Astatotilapia latifasciata, transcribes a potentially noncoding RNA. CHROMOSOMA, v. 126, n. 2, p. 313-323, MAR 2017. Citações Web of Science: 15.

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