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Caracterização molecular do Vírus da Hepatite C em portadores de doença renal crônica em hemodiálise

Processo: 12/18168-2
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de fevereiro de 2013
Vigência (Término): 31 de agosto de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Isabel Maria Vicente Guedes de Carvalho Mello
Beneficiário:Rafael Alves da Silva
Instituição-sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Hepatite C   Biologia computacional   Diálise renal   Insuficiência renal crônica

Resumo

As dificuldades relacionadas ao iagnóstico e ao tratamento contra a infecção pelo vírus da hepatite C (HCV) têm estimulado pesquisas na área de desenvolvimento de fármacos. Os novos tratamentos possuem como principal característica a inibição direta do vírus impedindo a função de proteínas essencias na sua replicação. Esse mecanismo de função singular dos novos tratamentos torna o conhecimento das caracteríscas moleculares do vírus de extrema importância. Pacientes com comprometimento renal e em sessões de hemodiálise possuem características diferentes dos pacientes com função renal normal. A ribavirina (RBV) não é bem absorvida pelo sistema e o uso do interferon se restringe ao convencional (INFc). O risco de infecção durante a hemodiálise e a diferença da pressão seletiva exercida pelo tratamento nesse grupo de pacientes levanta questões sobre as características moleculares dessa população viral. O Objetivo desse estudo é caracterizar molecularmente as variantes do HCV circulantes nos portadores de doença renal crônica sob hemodiálise em comparação com as variantes do HCV de pacientes com função renal normal. Dois grupos de pacientes serão analisados nesse trabalho. O primeiro grupo irá contar com 100 pacientes portadores de infecção crônica pelo HCV com doença renal crônica sob terapia hemodialítica há pelo menos 1 ano e o segundo grupo contará com 100 pacientes portadores de infecção crônica pelo HCV sem comprometimento da função renal. O RNA Viral dos pacientes sera extraído, amplificado e sequenciado nas regiões as regiões NS3 (~620nt) e NS5B (~800nt). Após a validação, alinhamento e edição manual das sequências serão realizadas análises filogenéticas de distância e verossimilhança para genotipagem, busca de regiões conservadas através de cálculos de entropia e motifs conservados além da análise do resultado da filogenia em busca de padrão de ramificação entre os dois grupos de pacientes. Espera-se ao fim deste trabalho conhecer melhor as características moleculares das variantes de HCV dos pacientes portadores de doença renal crônica identificando possíveis padrões genéticos e polimorfismos característicos destes dois grupos.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DA SILVA, RAFAEL ALVES; TODAO, JARDELINA DE SOUZA; KAMITANI, FERNANDO LUIZ; BENEDITO SILVA, ANTONIO EDUARDO; DE CARVALHO-FILHO, ROBERTO JOSE; CARDOSO GOMES FERRAZ, MARIA LUCIA; VICENTE GUEDES DE CARVALHO, ISABEL MARIA. Molecular characterization of hepatitis C virus in end-stage renal disease patients under hemodialysis. Journal of Medical Virology, v. 90, n. 3, p. 537-544, MAR 2018. Citações Web of Science: 1.
DA SILVA, RAFAEL ALVES; VICENTE GUEDES DE CARVALHO, ISABEL MARIA; ADUM DE MATOS, RENATA PRANDINI; TOMONARI YAMASAKI, LILIAN HIROMI; BITTAR, CINTIA; RAHAL, PAULA; GOMES JARDIM, ANA CAROLINA. Evidence of bottleneck effect on hepatitis C virus transmission between a couple under interferon based therapy. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 47, p. 87-93, JAN 2017. Citações Web of Science: 1.
DE CARVALHO, ISABEL M. V. G.; ALVES, RAFAEL; VASCONCELOS-MEDEIROS DE SOUZA, POLYANA A.; DA SILVA, EDVALDO F.; MAZO, DANIEL; CARRILHO, FLAIR J.; QUEIROZ, ARTUR T. L.; PESSOA, MARIO G. Protease Inhibitor Resistance Mutations in Untreated Brazilian Patients Infected with HCV: Novel Insights about Targeted Genotyping Approaches. Journal of Medical Virology, v. 86, n. 10, p. 1714-1721, OCT 2014. Citações Web of Science: 12.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
SILVA, Rafael Alves da. A exaustão de Sisifo : gestão produtiva, trabalhador contemporaneo e novas formas de controle. 2008. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Filosofia e Ciências Humanas.

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