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Evolução molecular de regiões regulatórias de genes HOX associados com a morfologia da nadadeira de peixes, com especial ênfase em Chondrichthyes

Processo: 12/05152-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2013
Vigência (Término): 29 de fevereiro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Zoologia
Pesquisador responsável:Marcelo Rodrigues de Carvalho
Beneficiário:Murilo de Carvalho
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):13/05292-0 - Evolução molecular de regiões regulatórias de genes HOX associados com a morfologia da nadadeira de peixes, com especial ênfase em Chondrichthyes, BE.EP.PD
Assunto(s):Chondrichthyes

Resumo

A evolução das regiões de regulação gênica, em especial nos genes expressos durante o desenvolvimento embrionário, parece estar diretamente relacionada com processos evolutivos que resultam na origem de novas morfologias, dado que variações em regiões regulatórias determinam mudanças nos padrões de expressão de genes durante a formação de estruturas específicas. A presente proposta de pesquisa objetiva investigar associações entre a sequência de nucleotídeos da região regulatória CsB, que controla a expressão dos genes mais próximos da extremidade 5' do cluster do HoxD (i.e. Hoxd11 e Hoxd13) durante a formação do broto dos apêndices pareados nos vertebrados. As sequências serão analisadas quanto à presença tanto de regiões conservadas quanto de regiões com altas taxas de substituição de nucleotídeos, para posterior inferência sobre presença de sítios de ligação para fatores de transcrição específicos. Serão analisadas espécies de condrictes que representem a maior parte da variação morfológica das nadadeiras dos principais clados (i.e. Squalomorphi e Galeomorphi) e comparados com representantes dos grandes grupos de Actinopterygii. Os fragmentos da referida região regulatória serão obtidos a partir de reações de PCR com posterior clonagem e sequenciamento. Para tanto, serão utilizados primers degenerados desenvolvidos no laboratório colaborador deste projeto (FFCLRP-USP) os quais foram previamente testados, com sucesso, em estudo preliminar à presente proposta. O grupo escolhido visa mostrar como (e se) a variação morfológica das nadadeiras dos peixes é resultante da evolução molecular desta região regulatória. Este estudo também contribuirá para o entendimento da evolução genotípica em espécies não-modelos nos estudos de biologia evolutiva do desenvolvimento.

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Microtomografia síncrotron desvenda coração de fósseis 
Matéria(s) publicada(s) na Revista Pesquisa FAPESP sobre a bolsa::
Coração de pedra 

Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
WEIGMANN, SIMON; VAZ, DIEGO F. B.; WHITE, WILLIAM T.; DE CARVALHO, MARCELO R.; THIEL, RALF. Distribution and comments on the morphology of Centroscymnus owstonii Garman, 1906 (Squaliformes: Somniosidae), with focus on its occurrence in the Indian Ocean. MARINE BIODIVERSITY, v. 46, n. 3, p. 641-653, SEP 2016. Citações Web of Science: 2.
MALDANIS, LARA; CARVALHO, MURILO; ALMEIDA, MARIANA RAMOS; FREITAS, FRANCISCO IDALECIO; FERREIRA GOMES DE ANDRADE, JOSE ARTUR; NUNES, RAFAEL SILVA; ROCHITTE, CARLOS EDUARDO; POPPI, RONEI JESUS; FREITAE, RAUL OLIVEIRA; RODRIGUES, FABIO; SILJESTROM, SANDRA; LIMA, FREDERICO ALVES; GALANTE, DOUGLAS; CARVALHO, ISMAR S.; PEREZ, CARLOS ALBERTO; DE CARVALHO, MARCELO RODRIGUES; BETTINI, JEFFERSON; FERNANDEZ, VINCENT; XAVIER-NETO, JOSE. Heart fossilization is possible and informs the evolution of cardiac outflow tract in vertebrates. eLIFE, v. 5, APR 19 2016. Citações Web of Science: 13.
CARVALHO, MURILO; VARI, RICHARD P. Development of the splanchnocranium in Prochilodus argenteus (Teleostei: Characiformes) with a discussion of the basal developmental patterns in the Otophysi. ZOOLOGY, v. 118, n. 1, p. 34-50, FEB 2015. Citações Web of Science: 3.
WHITE, WILLIAM T.; VAZ, DIEGO F. B.; HO, HSUAN-CHING; EBERT, DAVID A.; DE CARVALHO, MARCELO R.; CORRIGAN, SHANNON; ROCHEL, ELISABETH; DE CARVALHO, MURILO; TANAKA, SHO; NAYLOR, GAVIN J. P. Redescription of Scymnodon ichiharai Yano and Tanaka 1984 (Squaliformes: Somniosidae) from the western North Pacific, with comments on the definition of somniosid genera. ICHTHYOLOGICAL RESEARCH, v. 62, n. 2, p. 213-229, JAN 2015. Citações Web of Science: 4.
CARVALHO, MURILO; BOCKMANN, FLAVIO ALICINO; DE CARVALHO, MARCELO RODRIGUES. Homology of the Fifth Epibranchial and Accessory Elements of the Ceratobranchials among Gnathostomes: Insights from the Development of Ostariophysans. PLoS One, v. 8, n. 4 APR 18 2013. Citações Web of Science: 17.

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