O papel da regulação gênica na evolução morfológica

• Processo: 12/23360-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de maio de 2013
• Vigência (Término): 30 de abril de 2014
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia - Morfologia dos Grupos Recentes
• Pesquisador responsável: Miguel Trefaut Urbano Rodrigues
• Beneficiário: Juliana Gusson Roscito
• Supervisor: Michael Hiller
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Local de pesquisa: Max Planck Society, Dresden, Alemanha
• Vinculado à bolsa: 12/01319-8 - Evolução dos mecanismos de desenvolvimento envolvidos com a redução dos membros em Squamata, BP.PD
• Assunto(s): Biologia do desenvolvimento Biologia computacional Lagartos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Elementos cis-regulatórios | Evolução genômica | lagartos | redução de membros | Biologia do Desenvolvimento

Resumo

Elementos cis-regulatórios são regiões do DNA ricas em sítios de ligação para fatores de transcrição. Estas regiões estão ultimamente relacionadas ao controle da expressão gênica, modulando quantitativamente a expressão de genes em tempos e locais específicos, e mudanças na expressão de genes que participam da padronização de estruturas embrionárias são consideradas como importantes fonte de variações evolutivas. A identificação e caracterização da estrutura de elementos regulatórios distribuídos pelo genoma está avançando rapidamente em função do desenvolvimento e popularização de técnicas de sequenciamento em larga-escala e de ferramentas computacionais que permitem a análise da organização genômica e a predição da estrutura e conservação evolutiva de elementos cis-regulatórios e de sítios de ligação para fatores de transcrição. Este projeto tem como base a utilização de ferramentas computacionais para analisar comparativamente o genoma de vertebrados de forma a identificar elementos cis-regulatórios relacionados ao controle da expressão de genes que participam do desenvolvimento dos membros, e estimar seu grau de conservação entre as espécies analisadas. Também está proposto o sequenciamento de alguns dos elementos regulatórios identificados previamente para espécies de lagartos que apresentam membros bem desenvolvidos e membros com diferentes graus de redução, de forma a analisar a presença/ausência de sítios de ligação para fatores de transcrição; esta abordagem permitirá identificar possíveis relações entre a estrutura de elementos cis-regulatórios e o fenótipo dos membros. (AU)