Estrutura genética de espécies de cactaceae do grupo pilosocereus aurisetus utilizando marcadores microssatélites desenvolvidos a partir de sequenciamento de nova geração

• Processo: 12/22857-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2013
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Evandro Marsola de Moraes
• Beneficiário: Isabel Aparecida da Silva Bonatelli
• Instituição Sede: Centro de Ciências Humanas e Biológicas (CCHB). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Sequenciamento de nova geração Genética populacional Diversidade genética Cactaceae
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cactaceae | Diversidade Genética | DNA microssatélite | estruturação populacional | Populações fragmentadas | sequenciamento de nova geração | Genética de Populações

Resumo

O grupo de cactáceas PILOSOCEREUS AURISETUS é composto por oito espécies que ocorrem associadas a afloramentos rochosos em ambientes xéricos no nordeste, centro-oeste e sudeste do Brasil. O padrão de distribuição disjunta das populações em conjunto com dados genéticos sugere que a evolução do grupo foi influenciada por eventos de vicariância envolvendo mudanças na distribuição das espécies e contato secundário com fluxo gênico. Os níveis atuais de fluxo gênico são extremamente baixos e de forma geral os grupos genéticos são mais bem explicados pela distribuição geográfica das populações do que pela taxonomia atual. No centro-oeste, a estrutura genética de P. machrisii, a espécie mais amplamente distribuída, é bastante complexa e pode estar relacionada à grande diversidade morfológica dessa região. No entanto, a baixa variação nos marcadores utilizados e a baixa amostragem nessa região não permitiram um melhor entendimento dessa estrutura. O objetivo desse projeto é utilizar dados genômicos a serem obtidos com sequenciamento de nova geração para desenvolver um conjunto grande de marcadores microssatélites altamente variáveis e com uniformidade no seu modo de evolução. Esses marcadores serão utilizados em conjunto com uma amostragem extensiva na região centro-oeste para investigar a história de diversificação do grupo P. AURISETUS.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BONATELLI, ISABEL A. S.; CARSTENS, BRYAN C.; MORAES, EVANDRO M.. Using Next Generation RAD Sequencing to Isolate Multispecies Microsatellites for Pilosocereus (Cactaceae). PLoS One, v. 10, n. 11, NOV 11 2015. (12/22477-0, 12/22857-8)

PEREZ, MANOLO F.; FRANCO, FERNANDO F.; BOMBONATO, JULIANA R.; BONATELLI, ISABEL A. S.; KHAN, GULZAR; ROMEIRO-BRITO, MONIQUE; FEGIES, ANA C.; RIBEIRO, PAULIANNY M.; SILVA, GISLAINE A. R.; MORAES, EVANDRO M.. Assessing population structure in the face of isolation by distance: Are we neglecting the problem?. DIVERSITY AND DISTRIBUTIONS, v. 24, n. 12, p. 1883-1889, DEC 2018. (12/22943-1, 12/22857-8, 15/06160-5)

PEREZ, MANOLO F.; BONATELLI, ISABEL A. S.; ROMEIRO-BRITO, MONIQUE; FRANCO, FERNANDO F.; TAYLOR, NIGEL P.; ZAPPI, DANIELA C.; MORAES, EVANDRO M.. oalescent-based species delimitation meets deep learning: Insights from a highly fragmented cactus syste. MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES, v. 22, n. 3, OCT 2021. (12/22857-8, 15/06160-5, 12/22943-1)