Bolsa de Treinamento Técnico 3 (TT3) concedida como cota de bolsa orçamentária do projeto 2011/50146-6 intitulado "Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios Neotropicais".

• Processo: 13/00218-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia - Taxonomia dos Grupos Recentes
• Pesquisador responsável: Miguel Trefaut Urbano Rodrigues
• Beneficiário: Jéssica Paula Gillung
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/50146-6 - Filogeografia comparada, filogenia, modelagem paleoclimática e taxonomia de répteis e anfíbios neotropicais, AP.BTA.TEM
• Assunto(s): Filogenia Filogeografia Répteis Análise de sequência de DNA Anfíbios
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Anfíbios | Filogenia | Filogeografia | Répteis | Sequenciamento de DNA | Anfíbios e Repteis

Resumo

Este projeto visa dar continuidade e ampliar os horizontes da linha interdisciplinar de pesquisa do laboratório de Herpetologia voltada para o estudo da sistemática e da evolução da herpetofauna neotropical e da biogeografia histórica de répteis, anfíbios e pequenos mamíferos neotropicais. De modo a agilizarmos a coleta de dados moleculares do projeto é indispensável contarmos com um bolsista de apoio técnico com nível superior para nos auxiliar com os procedimentos de extração, amplificação e sequenciamento de DNA. De acordo com os objetivos do programa de Capacitação Técnica e do Projeto Temático, faz-se necessário um profissional com conhecimentos teóricos de Genética, Evolução e Biologia Molecular. A extração de DNA a partir de amostras de fígado e músculo, congeladas ou preservadas em etanol, será realizada através do protocolo de extração salina. A amplificação dos fragmentos gênicos do DNA mitocondrial e nuclear pela técnica de PCR (Polymerase Chain Reaction) seguirá as condições previamente padronizadas pelos pesquisadores. Os produtos da amplificação serão caracterizados em gel de agarose 2% e os produtos individuais de PCR serão purificados com Shrimp Alkaline Phosphatase (SAP, 1u/ml) e Exonuclease I (10 u/ml) e a reação de seqüenciamento será feita com o kit BigDye Mix Terminator (Perkin Elmer). Os fragmentos de fita dupla serão seqüenciados utilizando-se o sistema "Perkin Elmer ABI PRISM Dye Terminator Cycle Sequencing Ready Reaction" (PE Applied Biosystems). Os procedimentos básicos a serem desenvolvidos estão apresentados na parte metodológica do projeto. Os registros de todo o material coletado durante o projeto será inserido no programa SINBIOTA. Além disso, serão inseridos os dados obtidos durante 12 campanhas de amostragem realizadas sob minha coordenação em projeto patrocinado por FURNAS CENTRAIS ELÉTRICAS. Estas correspondem a excelentes coleções de répteis, anfíbios, aves e mamíferos obtidas em 8 localidades (quatro delas foram amostradas no período úmido e seco) ao longo de um transecto latitudinal da Mata Atlântica dos Estados de São Paulo e Paraná. Os dados serão extraídos de nossos relatórios e conferidos com a numeração correspondente do Museu de Zoologia da USP.