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Avaliação da expressão gênica e proteica em processos inflamatórios e neoplasias do trato digestório: estômago e colorretal

Processo: 13/00796-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de março de 2013
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Ana Elizabete Silva
Beneficiário:Ayla Blanco Poltronieri
Instituição-sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:12/15036-8 - Avaliação da expressão gênica e protéica em processos inflamatórios e neoplasias do trato digestório: estômago e colorretal, AP.R
Assunto(s):Expressão de proteínas   Neoplasias gástricas   Helicobacter pylori   Expressão gênica

Resumo

1. Deverá fazer um treinamento para manipulação do equipamento de PCR em tempo real para auxiliar alunos de pós-graduação, estagiários e docentes que pretendam utilizar a técnica. 2. Auxiliar nas diferentes etapas para avaliação da expressão gênica pela técnica de PCR em tempo real. A partir das biópsias ou fragmentos cirúrgicos de tecidos do estômago e colorretal (normal e tumoral) deverá auxiliar na extração de RNA e DNA, medida da concentração dos ácidos nucléicos em Nanodrop, síntese do cDNA (transcrição reversa). 3. Auxiliar na padronização e otimização das condições técnica de PCR em tempo real para avaliação da expressão relativa do RNAm dos genes que serão avaliados neste projeto: TLR2, TLR4, IL-8, TGF-², PAP, PAI-1, PLAT, IFITM1, ANXA1 e LGALS1. 4. Auxiliar nas diferentes etapas para estudo dos polimorfismos funcionais, como extração de DNA de sangue periférico e na padronização das melhores condições da técnica de PCR/RFLP (Polymerase Chain Reaction/Restriction Fragment Length Polymorphism) dos polimorfismos dos genes TLR2 e TLR4 a serem investigados; 5. Auxiliar em diferentes etapas para o estudo de imuno-histoquímica como sinalização das lâminas, aprendizagem do uso do micrótomo para realização dos cortes histológicos e fixação das lâminas; 6. Elaborar banco de dados dos sujeitos da pesquisa (grupos de câncer, lesões pré- cancerosas e controles), quanto aos os dados como idade, sexo, etnia, fatores de risco (etilismo, tabagismo) e os resultados das análises de expressão gênica e polimorfismos avaliados para auxiliar nas análises estatísticas; 7. Fazer cotações de materiais de consumo do laboratório e pedidos de compra utilizados no projeto; 8. Auxiliar em atividades gerais do laboratório como preparo de soluções, lavagem e esterilização de materiais. 9. Fazer levantamento bibliográfico de artigos relacionados ao projeto. A bolsista irá atuar em todas as atividades relacionadas acima durante todo o período de concessão da bolsa, conforme o andamento do projeto, sendo que as etapas de levantamento bibliográfico, cotações e compras de materiais, preparo de soluções e lavagem de materiais serão realizadas continuadamente. 1º e 2º semestres: Treinamento em PCR em tempo real; extração de DNA e RNA a partir das biópsias e sangue periférico a medida que as amostras são coletadas; medida da concentração dos ácidos nucléicos em Nanodrop; padronização das condições das técnicas de PCR-RFLP; padronização/otimização das condições da técnica de PCR em tempo real para os genes que serão avaliados; início da elaboração de banco de dados e cadastramento dos sujeitos de pesquisa e dos resultados parciais; 3º e 4º semestres: etapas para análise de imuno-histoquímica como silanização das lâminas, cortes histológicos e fixação do material; continuidade nas etapas de análise de expressão gênica; finalização do cadastramento dos resultados no banco de dados; análises estatísticas dos dados; 4º semestre: levantamento bibliográfico, análise dos resultados finais e elaboração do relatório final.