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Construindo uma plataforma de biologia sintética para a triagem funcional de sequências promotoras em plantas

Processo: 12/21064-4
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de março de 2013
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Marie-Anne van Sluys
Beneficiário:Edgar Andrés Ochoa Cruz
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/52074-0 - Sugarcane genome sequence: plant transposable elements are active contributors to gene structure variation, regulation and function, AP.BIOEN.TEM
Assunto(s):Biologia sintética

Resumo

A biologia sintética usa a engenharia de vários genes para a construção de circuitos de DNA que podem ser programados para controlar o comportamento celular. A criação de partes genéticas padrão a serem usadas como blocos de construção e montadas de maneira confiável é uma necessidade. Assim como, a compreensão da estrutura mínima e combinação de genes ou informações que são necessárias para a criação de uma função específica. Esta nova área precisa de ferramentas que permitam a criação, caracterização e incorporação destas novas partes genéticas em uma alta escala, assim como, o seu depósito nas bases dados.O problema que este projeto pretende abordar é a necessidade de ferramentas para caracterizar partes genéticas de uma forma experimental rápida, como são as regiões promotoras de plantas (partes genéticas) e seus padrões de expressão específicos de tecidos (contexto de interação).Como prova de conceito o projeto irá gerar uma biblioteca de sequências promotoras de tabaco usando uma estratégia de clonagem aleatória de regiões genômicas, previamente estabelecida para cana-de-açúcar no GaTELab da Universidade de São Paulo. A biblioteca terá um componente virtual e outro físico.Alem de ampliar o uso da clonagem aleatória de promotores em tabaco, o principalobjetivo deste projeto é desenvolver a plataforma de triagem in planta que usa a expressãoconstitutiva da proteína fluorescente vermelha como indicador de atividade tecido-especificodos promotores em tabaco. A biblioteca de tabaco e uma biblioteca de cana-de-açúcar, criadapreviamente com esta mesma estratégia, serão usadas para testar a plataforma

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
OCHOA CRUZ, EDGAR ANDRES; QUEIROGA CRUZ, GUILHERME MARCELLO; VIEIRA, ANDREIA PRATA; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Virus-like attachment sites as structural landmarks of plants retrotransposons. MOBILE DNA, v. 7, JUL 28 2016. Citações Web of Science: 0.

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