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Caracterização das interações macromoleculares das proteínas envolvidas na síntese de selenocisteínas em escherichia coli

Processo: 12/23730-1
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de abril de 2013
Vigência (Término): 31 de agosto de 2013
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Otavio Henrique Thiemann
Beneficiário:Vitor Hugo Balasco Serrão
Instituição-sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/57910-0 - Instituto Nacional de Biotecnologia Estrutural e Química Medicinal em Doenças Infecciosas - INBEQMeDI, AP.TEM
Assunto(s):Tradução

Resumo

O estudo de processos de tradução do código genético em proteínas desperta o interesse pelo seu papel central no metabolismo celular, em particular, o estudo da via de síntese de novos aminoácidos, como a selenocisteína e a pirrolisina, que resultam na expansão do código genético dos 20 aminoácidos tradicionais para um total de 22 aminoácidos. A selenocisteína (Sec, U) representa a principal forma biológica do elemento selênio e sua incorporação é um processo co-traducional em selenoproteínas como resposta ao códon UGA em fase e requer uma complexa maquinaria molecular. O repertório completo de genes envolvidos na via de síntese desse aminoácido em procariotos é conhecido, porém as interações moleculares entre as diferentes proteínas não é bem caracterizada. Este projeto visa à caracterização molecular e estrutural das interações entre a Selenocisteína Sintase (SELA) e Fator de Elongação específico para selenocisteínas (SELB) com ribossomo em Escherichia coli. Para isso, medidas de Anisotropia de Fluorescência e Técnicas de Microcalorimetria serão utilizadas para determinação das constantes de interação desses complexos proteicos. A fim de obter modelos estruturais, serão empregadas técnicas de Microscopia Eletrônica utilizando coloração negativa (Negative Stain) Crio-Microscopia Eletrônica de alta resolução (Crio-ME) e Espectrometria de Massa com Troca Hidrogênio/Deutério (HDEX). Os estudos propostos irão auxiliar no entendimento do mecanismo de incorporação deste aminoácido em bactérias bem como nos demais domínios da vida. (AU)

Publicações científicas (11)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
TORINI, JULIANA ROBERTA; FERNANDES, ADRIANO DE FREITAS; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; ROMANELLO, LARISSA; BIRD, LOUISE E.; NETTLESHIP, JOANNE E.; OWENS, RAYMOND J.; BRANDAO-NETO, JOSE; ZERAIK, ANA ELIZA; DEMARCO, RICARDO; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ. Characterization of a Schistosoma mansoni NDPK expressed in sexual and digestive organs. Molecular and Biochemical Parasitology, v. 231, JUL 2019. Citações Web of Science: 0.
ROMANELLO, LARISSA; ZERAIK, ANA ELIZA; FERNANDES, ADRIANO DE FREITAS; TORINI, JULIANA ROBERTA; BIRD, LOUISE E.; NETTLESHIP, JOANNE E.; RADA, HEATHER; REDDIVARI, YAMINI; OWENS, RAY J.; SERRAO, VITOR HUGO BALASCO; DEMARCO, RICARDO; BRANDAO-NETO, JOSE; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ. In vitro and in vivo characterization of the multiple isoforms of Schistosoma mansoni hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferases. Molecular and Biochemical Parasitology, v. 229, p. 24-34, APR 2019. Citações Web of Science: 0.
TORINI, JULIANA ROBERTA; ROMANELLO, LARISSA; HELENO BATISTA, FERNANDA APARECIDA; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; FAHEEM, MUHAMMAD; ZERAIK, ANA ELIZA; BIRD, LOUISE; NETTLESHIP, JOANNE; REDDIVARI, YAMINI; OWENS, RAY; DEMARCO, RICARDO; BORGES, JULIO CESAR; BRANDAO-NETO, JOSE; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ. The molecular structure of Schistosoma mansoni PNP isoform 2 provides insights into the nucleoside selectivity of PNPs. PLoS One, v. 13, n. 9 SEP 7 2018. Citações Web of Science: 2.
BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; SILVA, IVAN ROSA; ALVES DA SILVA, MARCO TULIO; SCORTECCI, JSSICA FERNANDES; FERNANDES, ADRIANO DE FREITAS; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE. The unique tRNA(Sec) and its role in selenocysteine biosynthesis. Amino Acids, v. 50, n. 9, p. 1145-1167, SEP 2018. Citações Web of Science: 0.
DANIELLE GAVA; VITOR HUGO BALASCO SERRÃO; LANA TEIXEIRA FERNANDES; MAURICIO EGÍDIO CANTÃO; JANICE REIS CIACCI-ZANELLA; NELSON MORÉS; REJANE SCHAEFER. Structure analysis of capsid protein of Porcine circovirus type 2 from pigs with systemic disease. Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, n. 2, p. -, Jun. 2018.
GAVA, DANIELLE; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; FERNANDES, LANA TEIXEIRA; CANTAO, MAURICIO EGIDIO; CIACCI-ZANELLA, JANICE REIS; MORES, NELSON; SCHAEFER, REJANE. Structure analysis of capsid protein of Porcine circovirus type 2 from pigs with systemic disease. Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, n. 2, p. 351-357, APR-JUN 2018. Citações Web of Science: 0.
SCORTECCI, JESSICA FERNANDES; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; CHELESKI, JULIANA; TORINI, JULIANA ROBERTA; ROMANELLO, LARISSA; DEMARCO, RICARDO; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ. Spectroscopic and calorimetric assays reveal dependence on dCTP and two metals (Zn2+ + Mg2+) for enzymatic activity of Schistosoma mansoni deoxycytidylate (dCMP) deaminase. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1865, n. 11, A, p. 1326-1335, NOV 2017. Citações Web of Science: 1.
BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; ROMANELLO, LARISSA; CASSAGO, ALEXANDRE; TORINI DE SOUZA, JULIANA ROBERTA; CHELESKI, JULIANA; DEMARCO, RICARDO; BRANDAO-NETO, JOSE; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ. Structure and kinetics assays of recombinant Schistosoma mansoni dihydrofolate reductase. Acta Tropica, v. 170, p. 190-196, JUN 2017. Citações Web of Science: 3.
ROMANELLO, LARISSA; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; TORINI, JULIANA ROBERTA; BIRD, LOUISE E.; NETTLESHIP, JOANNE E.; RADA, HEATHER; REDDIVARI, YAMINI; OWENS, RAY J.; DEMARCO, RICARDO; BRANDAO-NETO, JOSE; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ. Structural and kinetic analysis of Schistosoma mansoni Adenylosuccinate Lyase (SmADSL). Molecular and Biochemical Parasitology, v. 214, p. 27-35, JUN 2017. Citações Web of Science: 7.
ZERAIK, ANA ELIZA; BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; ROMANELLO, LARISSA; TORINI, JULIANA ROBERTA; CASSAGO, ALEXANDRE; DEMARCO, RICARDO; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ. Schistosoma mansoni displays an adenine phosphoribosyltransferase preferentially expressed in mature female gonads and vitelaria. Molecular and Biochemical Parasitology, v. 214, p. 82-86, JUN 2017. Citações Web of Science: 5.
BALASCO SERRAO, VITOR HUGO; TORINI DE SOUZA, JULIANA ROBERTA; ROMANELLO, LARISSA; PEREIRA, HUMBERTO D'MUNIZ. Schistosoma mansoni Purine and Pyrimidine Biosynthesis: Structures and Kinetic Experiments in the Search for the Best Therapeutic Target. CURRENT PHARMACEUTICAL DESIGN, v. 23, n. 45, p. 6967-6983, 2017. Citações Web of Science: 2.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
SERRÃO, Vitor Hugo Balasco. Caracterização das interações macromoleculares das proteínas envolvidas na síntese de selenocisteínas em Escherichia coli. 2017. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos São Carlos.

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