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Caracterização de microssatélites para Bokermannohyla ibitiguara (Anura, Hylidae)

Processo: 13/04023-5
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Vigência (Início): 17 de junho de 2013
Vigência (Término): 16 de setembro de 2013
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Cynthia Peralta de Almeida Prado
Beneficiário:Renato Christensen Nali
Supervisor no Exterior: Kelly R. Zamudio
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
Local de pesquisa : Cornell University, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:12/06228-0 - Diversificação genética, morfológica e acústica em populações de um anuro endêmico da Serra da Canastra, BP.DR
Assunto(s):Reação em cadeia por polimerase (PCR)   Cerrado

Resumo

Estudos com genética de paisagem - definida como a união de genética de populações com ecologia da paisagem - tem aumentado nos últimos anos, sendo um método importante para entender a estrutura genética das populações ao longo de sua distribuição geográfica. Os marcadores moleculares mais apropriados para este tipo de estudo são os microssatélites, apesar de que sua alta especificidade requer o desenvolvimento de marcadores específicos para cada espécie ou gênero. Este projeto tem como objetivo caracterizar e otimizar microssatélites para Bokermannohyla ibitiguara, um anuro de reprodução em riachos, endêmico da Serra da Canastra, no cerrado brasileiro. Testaremos também a amplificação cruzada dos mesmos microssatélites em outras três espécies do gênero. De uma biblioteca genômica já desenvolvida pela Cornell University, NY, EUA, serão otimizados ao menos oito locos que obedecerem os seguintes critérios: (1) serem polimórficos; (2) amplificarem confiavelmente e (3) produzirem picos de amplificação perfeitos. As amostras de tecidos terão o DNA extraído com solução Chelex (Chelex-100, Bio-Rad) e proteinase K. Reações de polimerase em cadeia (PCR) serão seguidas de grupos multiplexados, usando um método de três primers simultâneos para genotipagem durante a eletroforese. Os microssatélites otimizados serão extremamente úteis, não apenas para as análises de genética de paisagem para B. ibitiguara, como previsto pelo projeto original associado, mas também para auxiliar em estudos de comportamento (e.g., análise de paternidade) e genética de populações envolvendo outras espécies do gênero Bokermannohyla. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
NALI, RENATO C.; BECKER, CARLOS GUILHERME; ZAMUDIO, KELLY R.; PRADO, CYNTHIA P. A. Topography, more than land cover, explains genetic diversity in a Neotropical savanna tree frog. DIVERSITY AND DISTRIBUTIONS, AUG 2020. Citações Web of Science: 0.
NALI, RENATO C.; ZAMUDIO, KELLY R.; HADDAD, CELIO F. B.; PRADO, CYNTHIA P. A. Size-Dependent Selective Mechanisms on Males and Females and the Evolution of Sexual Size Dimorphism in Frogs. American Naturalist, v. 184, n. 6, p. 727-740, DEC 2014. Citações Web of Science: 24.
NALI, RENATO C.; ZAMUDIO, KELLY R.; PRADO, CYNTHIA P. A. Microsatellite markers for Bokermannohyla species (Anura, Hylidae) from the Brazilian Cerrado and Atlantic Forest domains. Amphibia-Reptilia, v. 35, n. 3, p. 355-360, 2014. Citações Web of Science: 3.

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