Mapeamento físico de sequências repetitivas de DNA no genoma de espécies do gênero Trichomycterus (Siluriformes, Trichomycteridae)

• Processo: 13/02701-6
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Vigência (Início): 01 de maio de 2013
• Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2015
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Fausto Foresti
• Beneficiário: Maria Lígia Marques de Oliveira
• Instituição-sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Trichomycterus Sequências repetitivas de ácido nucleico

Resumo

O estudo dos peixes Neotropicais tem-se expandido consideravelmente nos últimos anos, principalmente devido à incorporação de novas técnicas de obtenção e interpretação de dados. No entanto, o relacionamento entre muitos grupos necessita ainda de um melhor esclarecimento e a aplicação das técnicas de bandamento cromossômico, o emprego de fluorocromos base específicos, o uso da metodologia de análise filogenética e a hibridação in situ com sondas fluorescentes tem sido responsável por parte da expansão do conhecimento e compreensão dos processos evolutivos em peixes Neotropicais. Nesse sentido, o desenvolvimento de sondas específicas como as de genes ribossômicos e de histonas, constituídas por DNA de moderada repetitividade, as de DNA altamente repetitivo (DNA satélite) e o advento da microdissecção cromossômica (método que possibilita o isolamento direto de DNA de qualquer região citogeneticamente reconhecida), tem possibilitado a hibridização destes marcadores em cromossomos metafásicos através de técnica denominada FISH, permitindo o mapeamento destes genes nos cromossomos e ampliando as perspectivas de análise e estudo nesse grupo de vertebrados. O presente projeto se insere no programa geral de estudos de citogenética e genética molecular de peixes Neotropicais em desenvolvimento no Laboratório de Biologia e Genética de Peixes (IBB/UNESP/BOTUCATU) e tem por objetivo principal a análise citogenética em nível estrutural e molecular de espécies e populações de peixes do gênero Trichomycterus que ocorrem em diferentes bacias hidrográficas (T. iherengi - rio Tietê; T. diabolus - rio Paranapanema; T. zonatus - bacia Costeira do Sudeste e T. cf. mimonha - bacia do rio Grande). O trabalho se baseará na análise citogenética convencional (Giemsa, RONs, Bandamento C) e molecular, com amplo mapeamento físico de sequências de DNA, envolvendo a aplicação dos fluorocromos bases específicos CMA3 e DAPI, a localização dos genes de DNAr 18S e 5S, de sequências teloméricas (TTAGGG)n, a localização de clusters para a proteína Histona H1, H3 e H4 e a localização dos elementos retrotransponíveis Rex1, Rex3 e Rex6. O desenvolvimento do presente projeto contribuirá com informações para a identificação dos mecanismos ligados ao processo de diversificação cromossômica dentro do gênero Trichomycterus, para o conhecimento da estrutura cromossômica e organização de algumas sequências de DNA no genoma dos peixes e ainda contribuirá com informações que auxiliem no estabelecimento das possíveis relações filogenéticas e evolutivas entre as espécies e populações analisadas.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

OLIVEIRA, Maria Lígia Marques de. Mapeamento físico de sequênias repetitivas de DNA no genoma de espécies do gênero Trichomycterus (Siluriformes, Trichomycteridae). 2015. 45 f. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu)..