| Processo: | 12/25236-4 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de maio de 2013 |
| Data de Término da vigência: | 28 de fevereiro de 2015 |
| Área de conhecimento: | Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia |
| Pesquisador responsável: | Antonio Augusto Franco Garcia |
| Beneficiário: | Guilherme da Silva Pereira |
| Instituição Sede: | Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil |
| Assunto(s): | Genomas Melhoramento genético vegetal Locos de características quantitativas Marcador molecular |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Genoma | marcadores moleculares | quantitative trait loci | saccharum x officinarum | Sorghum bicolor | Melhoramento vegetal |
Resumo Sorgo sacarino e cana-de-açúcar são duas importantes gramíneas com fins potencialmente bioenergéticos. No entanto, apesar do conhecido relacionamento evolutivo, os genomas dessas espécies diferem em complexidade e tamanho. Sorghum bicolor é diploide, com número básico de cromossomos igual a dez, os quais totalizam cerac de 740 Mb já sequenciadas; já Saccharum x officinarum é um autopoliploide com frequente aneuploidia, e apresenta genoma monoploide estimado em cerca de 1 Gb. Provavelmente, decorre deste fato a relativa dificuldade em se realizar estudos genéticos em cana, e, como consequência, em se incrementar os trabalhos de melhoramento na espécie. Nesse contexto, a possibilidade de integrar estudos de mapeamento entre sorgo sacarino e cana-de-açúcar torna-se viável dado o emprego de metodologias adequadas. Neste trabalho, propõe-se mapear e comparar QTLs para caracteres de interesse agronômico nos genomas de ambas as espécies. Para tanto, serão utilizadas duas populações de mapeamento. A população de sorgo sacarino é constituída por 272 RILs densamente genotipadas por marcadores do tipo SNP mapeados fisicamente contra o genoma da espécie. A população de cana-de-açúcar constitui-se de uma progênie F1 segregante com 154 indivíduos a serem genotipados por marcadores SSR e SNPs. Os marcadores SNPs atualmente disponíveis para cana possibilitam a estimação de doses dos alelos, assim como a construção de mapas genéticos mais informativos, a partir de metodologias desenvolvidas pelo grupo de pesquisa ao qual este trabalho se vincula. As populações, já estabelecidas em campo, estão sendo avaliadas para fenótipos agro-industriais e relativos à resistência a doenças. As médias ajustadas para os indivíduos de cada população serão obtidas a partir da utilização de modelos mistos e, posteriormente, utilizadas na descoberta de QTLs. Essa etapa de identificação de QTLs envolverá a utilização de modelo de mapeamento por múltiplos intervalos na população de sorgo, e de modelo de mapeamento de múltiplos QTLs na população de cana, o qual será expandido para mapas baseados em múltiplas doses. A comparação entre os genomas será baseada nas sequências que originaram os marcadores em cana-de-açúcar, as quais serão buscadas no genoma completo de sorgo. A eventual existência de QTLs associados a regiões sintênicas possibilitará inferências a respeito do controle evolutivamente conservado de caracteres relacionados entre as espécies. Além disso, a descoberta de marcadores significativamente ligados aos QTLs poderá sugerir aplicações na clonagem de genes e na seleção assistida por marcadores. | |
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