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Análise do transcriptoma de microRNAs no tecido cardíaco da Tilápia do Nilo utilizando RNA-seq e genômica comparativa

Processo: 13/03644-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de maio de 2013
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Danillo Pinhal
Beneficiário:Arthur Casulli de Oliveira
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):14/08420-1 - Análise de miRNAs altamente expressos no coração da Tilápia do Nilo utilizando bioinformática, BE.EP.IC
Assunto(s):Peixes   Genética molecular   Genômica   MicroRNAs   Tilápia-do-Nilo   Sequenciamento de alta performance

Resumo

MicroRNAs (miRNAs) são pequenos RNAs não codificadores (~22 nucleotídeos) que regulam pós-transcricionalmente a expressão de RNAs mensageiros alvo controlando, assim, a produção de proteínas. Nos vertebrados, o envolvimento de miRNAs no controle do crescimento, desenvolvimento, resposta ao estresse e regeneração, dentre outros processos essenciais, tem sido demonstrado em vários órgãos, incluindo o coração. Ainda, a associação observada entre abundância e diversidade de miRNAs e aumento de complexidade do grupo taxonômico tornaram os miRNAs elementos relevantes tanto no entendimento da evolução de genes e mecanismos regulatórios, através de análises genômicas intraespecíficas, quanto como marcadores filogenéticos em investigações genômicas comparativas. Nos peixes, maior grupo de vertebrados viventes, dentre as ~30.000 espécies conhecidas apenas um pequeno número foi investigado quanto à composição e perfis de expressão de miRNAs. No presente projeto propõe-se o uso de sequenciamento de alta performance ("deep sequencing" ou RNA-seq) combinado à análise genômica comparativa com o objetivo de investigar a organização genômica, a diversidade e a dinâmica evolutiva do conjunto de miRNAs expressos no tecido cardíaco, utilizando como modelo biológico a tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus), que possui genoma completo sequenciado. A partir desses experimentos, será possível identificar combinações de miRNAs e RNAs mensageiros alvos e associá-los à evolução do genoma e à regulação de processos biológicos específicos. Destaca-se que a presente proposta está vinculada a um amplo projeto para caracterização de miRNAs, atualmente em desenvolvimento (Auxílio Regular à Pesquisa FAPESP - 2012/15589-7). (AU)

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