Busca avançada
Ano de início
Entree
Conteúdo relacionado

Seleção balanceadora e diferenciação populacional em genes HLA

Processo: 13/12162-5
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
Vigência (Início): 16 de setembro de 2013
Vigência (Término): 15 de março de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética
Pesquisador responsável:Diogo Meyer
Beneficiário:Débora Yoshihara Caldeira Brandt
Supervisor no Exterior: Jérôme Goudet
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Local de pesquisa : Université de Lausanne (UNIL), Suíça  
Vinculado à bolsa:12/22796-9 - Diferenciação populacional em genes sob forte seleção balanceadora: um estudo de caso com genes HLA, BP.MS
Assunto(s):Genética populacional   Diversidade genética   Evolução molecular

Resumo

A seleção balanceadora é um processo evolutivo importante, pois contribui para a manutenção da diversidade genética em populações. Diferentes mecanismos não mutuamente exclusivos são propostos para a seleção balanceadora. Entre eles, vantagem de heterozigotos, seleção dependente de frequência e seleção flutuante. Todos esses mecanismos podem explicar a alta diversidade encontrada nos genes HLA (do inglês, Human Leucocyte Antigen), que são o exemplo mais clássico de alvo de seleção balanceadora no genoma humano. Neste trabalho, propomos uma análise de diferenciação populacional nos genes HLA. Nossa expectativa é que essa análise será informativa sobre o mecanismo de ação da seleção balanceadora nesses genes e sobre o efeito da seleção balanceadora sobre a diferenciação entre populações. Especificamente, testaremos duas possibilidades contrastantes sobre o efeito da seleção balanceadora nos genes HLA para a diferenciação entre populações: (a) a seleção tem como resultado a manutenção de polimorfismos compartilhados entre populações, o que reduz a diferenciação; (b) a seleção tem como resultado o aumento na frequência de variantes localmente adaptativas, o que aumenta a diferenciação. Para isso, analisaremos dados de SNPs identificados em diferentes populações humanas, comparando a diferenciação populacional de SNPs localizados próximos a genes HLA à de SNPs em outras regiões do genoma. Usaremos também simulações para comparar diferentes cenários de seleção balanceadora em relação a seus efeitos sobre a diferenciação populacional. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BRANDT, DEBORA Y. C.; CESAR, JONATAS; GOUDET, JEROME; MEYER, DIOGO. The Effect of Balancing Selection on Population Differentiation: A Study with HLA Genes. G3-GENES, GENOMES, GENETICS, v. 8, n. 8, p. 2805-2815, AUG 2018. Citações Web of Science: 2.
BRANDT, DEBORA Y. C.; AGUIAR, VITOR R. C.; BITARELLO, BARBARA D.; NUNES, KELLY; GOUDET, JEROME; MEYER, DIOGO. Mapping Bias Overestimates Reference Allele Frequencies at the HLA Genes in the 1000 Genomes Project Phase I Data. G3-GENES, GENOMES, GENETICS, v. 5, n. 5, p. 931-941, MAY 1 2015. Citações Web of Science: 28.

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas escrevendo para: cdi@fapesp.br.
Mapa da distribuição dos acessos desta página
Para ver o sumário de acessos desta página, clique aqui.