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Detecção, quantificação e sequenciamento dos genes 16S rRNA e pmoA do filo Verrucomicrobia em solos sob cultivo de cana-de-açúcar

Processo: 13/05087-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de julho de 2013
Vigência (Término): 31 de agosto de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Tsai Siu Mui
Beneficiário:Andressa Monteiro Venturini
Instituição-sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Assunto(s):Verrucomicrobia   Sequenciamento   Microbiologia do solo   Reação em cadeia da polimerase em tempo real

Resumo

O filo Verrucomicrobia é um grupo de microrganismos gram-negativos recentemente adicionados ao Domínio Bacteria. Os organismos do filo Verrucomicrobia foram inicialmente observados em ambientes aquáticos, mas, atualmente, já foram encontrados nos mais diversos ambientes. No solo, os organismos do filo Verrucomicrobia representam de 1 a 10% de todo o gene 16S rRNA bacteriano presente, e estudos recentes indicam que o filo é dominante em muitas comunidades microbianas. Além disso, recentemente, foram descobertos organismos metanotróficos pertencentes ao filo, detectados pelo gene pmoA, responsável pela conversão do gás do efeito estufa metano em metanol. O Brasil é considerado o maior produtor mundial de cana-de-açúcar, que apresenta grande importância social e econômica, relacionada principalmente à produção de açúcar e álcool. A conversão de um sistema natural para agrícola altera a biomassa microbiana do solo e, além disso, o manejo da colheita da cana pode influenciar, entre outros fatores, nos atributos físicos, químicos e biológicos do solo. O filo Verrucomicrobia é afetado por características ambientais que mudam de acordo com o tempo e profundidade do solo. Além disso, diversos estudos revelaram que a abundância e a estrutura das comunidades de Verrucomicrobia podem ser afetadas pelo desmatamento e mudança de uso do solo. O presente trabalho tem como objetivo principal detectar, quantificar e sequenciar os genes 16S rRNA e pmoA de Verrucomicrobia através de métodos moleculares independentes de cultivo em amostras de solos sob cultivo de cana-de-açúcar crua e queimada por meio de um estudo comparativo com experimentos de mesocosmos estabelecidos em casa-de-vegetação.

Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
VENTURINI, Andressa Monteiro. Efeito do uso do solo e da rizosfera de cana-de-açúcar na estrutura e abundância de comunidades de Bacteria e do filo Verrucomicrobia. 2014. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Centro de Energia Nuclear na Agricultura Piracicaba.

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