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Análise do perfil transcripcional de tecidos lignificados em Tectona grandis L. f

Processo: 13/06299-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de setembro de 2013
Vigência (Término): 31 de março de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Helaine Carrer
Beneficiário:Esteban Galeano Gómez
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Assunto(s):Genômica   Expressão gênica   Análise de sequência de DNA

Resumo

A árvore de teca (Tectona grandis L. f.) é uma das espécies tropicais de maior interesse econômico atualmente devido as características singulares de sua madeira, como resistência, cor dourada e durabilidade. Contudo, apesar da expansão nas áreas de reflorestamento, pouco se conhece sobre a biologia desta espécie, especialmente no que se refere aos estudos moleculares. Uma vez que tais estudos podem contribuir para a compreensão da formação de madeira, este trabalho tem como objetivo a identificação e caracterização de genes potencialmente envolvidos nos processos de formação de tecidos lignificados por meio de análises detalhadas do transcriptoma de T. grandis. Em um primeiro momento será analisado o perfil transcripcional de tecidos lignificados da planta via RNAseq, posteriormente será avaliada a expressão diferencial de genes nos tecidos lignificados da teca, e finalmente serão conduzidos estudos para a caracterização da família de genes Cinamil Álcool Desidrogenase (CAD), essencial para a catalização da reação de formação dos monolignóis, precursores finais da lignina. Resultados prévios da expressão diferencial do gene CAD em teca mostraram maior transcrição em tecidos vasculares de ramo, seguido pelos tecidos de cerne do tronco, sendo que no interior do lenho das árvores o tecido que apresentou maior expressão foi o cerne, seguido por alburno e medula. Dessa forma, todos os trabalhos a serem realizados dispõem de ferramentas de bioinformática para a busca de genes diferencialmente expressos e importantes na formação de madeira em teca com os dados gerados no RNAseq, em seguida serão desenhados primers específicos a fim de avaliar diferenças na expressão por PCR em tempo real. A perspectiva do projeto é ampla e visa ter a identificação de unigenes importantes a partir do transcriptoma da teca em tecidos lignificados, com ênfase na família gênica CAD. (AU)

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Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GALEANO, ESTEBAN; VASCONCELOS, TARCISIO SALES; DE OLIVEIRA, PERLA NOVAIS; CARRER, HELAINE. Physiological and molecular responses to drought stress in teak (Tectona grandis L.f.). PLoS One, v. 14, n. 9 SEP 9 2019. Citações Web of Science: 0.
GALEANO, ESTEBAN; VASCONCELOS, TARCISIO SALES; CARRER, HELAINE. Characterization of Cinnamyl Alcohol Dehydrogenase gene family in lignifying tissues of Tectona grandis L.f.. SILVAE GENETICA, v. 67, n. 1, p. 1-11, FEB 2018. Citações Web of Science: 0.
TAMBARUSSI, EVANDRO V.; ROGALSKI, MARCELO; GALEANO, ESTEBAN; BRONDANI, GILVANO EBLING; DE MARTIN, VALENTINA DE FATIMA; DA SILVA, LUCAS AMERICO; CARRER, HELAINE. Efficient and new method for Tectona grandis in vitro regeneration. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 17, n. 2, p. 124-132, APR 2017. Citações Web of Science: 1.
GALEANO, E.; BARROSO, A. A. M.; VASCONCELOS, T. S.; LOPEZ-RUBIO, A.; ALBRECHT, A. J. P.; VICTORIA FILHO, R.; CARRER, H. EPSPS variability, gene expression, and enzymatic activity in glyphosate-resistant biotypes of Digitaria insularis. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 3 2016. Citações Web of Science: 0.
GALEANO, ESTEBAN; VASCONCELOS, TARCISIO SALES; VIDAL, MABEL; MEJIA-GUERRA, MARIA KATHERINE; CARRER, HELAINE. Large-scale transcriptional profiling of lignified tissues in Tectona grandis. BMC PLANT BIOLOGY, v. 15, SEP 15 2015. Citações Web of Science: 10.

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