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Estudo da resistência heterogênea à vancomicina em Staphylococcus aureus através da genética comparativa de subpopulações de um isolado

Processo: 13/12107-4
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de outubro de 2013
Vigência (Término): 30 de setembro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Elsa Masae Mamizuka
Beneficiário:John Anthony Mcculloch
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Staphylococcus aureus   Vancomicina

Resumo

A vancomicina é frequentemente a única alternativa contra infecções por S. aureus resistente a meticilina (MRSA). Cepas MRSA que não respondem ao tratamento com vancomicina são caracterizadas como resistentes (VRSA) ou intermediárias (VISA). Cepas com fenótipo VISA apresentam engrossamento da parede celular, o que pode ocorrer por conjuntos diferentes de mutações em vários genes. Ademais, certas linhagens apresentam o fenômeno de resistência heterogênea à vancomicina (hVISA), em subpopulações de uma única colônia apresentam concentrações inibitórias mínimas (CIMs) de vancomicina maiores que a mediana populacional total, o que pode levat a um resultado falso sensível no laboratório clínico. Essas subpopulações com CIMs maiores do que a maioria que não seriam detectadas por sequenciamento a partir de DNA extraído de uma massa de células obtidas por cultivo, já que genes não mutados dominariam a amostra. A presente proposta pretende usar uma abordagem de célula única (single cell) para identificar quais dos genes mutantes atribuídos ao fenótipo VISA encontram-se já presentes em todas as subpopulações de linhagens hVISA, e quais estão presentes em apenas algumas. Os genomas das células únicas hVISA isoladas por microdissecção a laser serão amplificados por MDA e sequenciados. O mesmo será feito com células de linhagens com fenótipo VISA e sensíveis à vancomicina (VSSA). O alinhamento dos scaffolds genômicos permitirá identificar polimorfismos nas sequências codificadoras entre subpopulações de cada linhagem hVISA, bem como entre essas e células de linhagens VISA e VSSA.

Publicações científicas (6)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BRASILIENSE, DANIELLE MURICI; BATISTA LIMA, KARLA VALERIA; PEREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA; MAMIZUKA, ELSA MASAE; SOUZA, CINTYA DE OLIVEIRA; GUIMARAES DUTRA, LIVIA MARIA; MCCULLOCH, JOHN ANTHONY. Emergence of carbapenem-resistant Acinetobacter pittii carrying the bla(OXA-72) gene in the Amazon region, Brazil. DIAGNOSTIC MICROBIOLOGY AND INFECTIOUS DISEASE, v. 93, n. 1, p. 82-84, JAN 2019. Citações Web of Science: 0.
PEREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA; MCCULLOCH, JOHN ANTHONY; MAMIZUKA, ELSA MASAE; LIMA MORAES, ALINE DA COSTA; FAVERI, MARCELO; FIGUEIREDO, LUCIENE CRISTINA; DUARTE, POLIANA MENDES; FERES, MAGDA. Do different probing depths exhibit striking differences in microbial profiles?. JOURNAL OF CLINICAL PERIODONTOLOGY, v. 45, n. 1, p. 26-37, JAN 2018. Citações Web of Science: 7.
FERNANDES, MIRIAM R.; MCCULLOCH, JOHN A.; VIANELLO, MARCO A.; MOURA, QUEZIA; PEREZ-CHAPARRO, PAULA J.; ESPOSITO, FERNANDA; SARTORI, LUCIANA; DROPA, MILENA; MATTE, MARIA H.; LIRA, DEBORA P. A.; MAMIZUKA, ELSA M.; LINCOPAN, NILTON. First Report of the Globally Disseminated IncX4 Plasmid Carrying the mcr-1 Gene in a Colistin-Resistant Escherichia coli Sequence Type 101 Isolate from a Human Infection in Brazil. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 60, n. 10, p. 6415-6417, OCT 2016. Citações Web of Science: 57.
MCCULLOCH, JOHN ANTHONY; DE OLIVEIRA SILVEIRA, ALESSANDRO CONRADO; LIMA MORAES, ALINE DA COSTA; PEREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA; SILVA, MANOELLA FERREIRA; ALMEIDA, LARA MENDES; D'AZEVEDO, PEDRO ALVES; MAMIZUKA, ELSA MASAE. Complete Genome Sequence of Staphylococcus aureus FCFHV36, a Methicillin-Resistant Strain Heterogeneously Resistant to Vancomycin. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 3, n. 4 JUL-AUG 2015. Citações Web of Science: 3.
DE ALMEIDA, LARA M.; PIRES, CARLOS; CERDEIRA, LOUISE T.; DE OLIVEIRA, THEO G. M.; MCCULLOCH, JOHN ANTHONY; PEREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA; SACRAMENTO, ANDREY G.; BRITO, ARTEMIR C.; DA SILVA, JOAS L.; DE ARAUJO, MARIA RITA E.; LINCOPAN, NILTON; MARTIN, MELISSA J.; GILMORE, MICHAEL S.; MAMIZUKA, ELSA M. Complete Genome Sequence of Linezolid-Susceptible Staphylococcus haemolyticus Sh29/312/L2, a Clonal Derivative of a Linezolid-Resistant Clinical Strain. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 3, n. 3 MAY-JUN 2015. Citações Web of Science: 2.
PEREZ-CHAPARRO, PAULA JULIANA; CERDEIRA, LOUISE TEIXEIRA; QUEIROZ, MAISE GOMES; SILVA DE LIMA, CLAYTON PEREIRA; LEVY, CARLOS EMILIO; PAVEZ, MONICA; LINCOPAN, NILTON; GONCALVES, EVONNILDO COSTA; MAMIZUKA, ELSA MASAE; MELLO SAMPAIO, JORGE LUIZ; TEIXEIRA NUNES, MARCIO ROBERTO; MCCULLOCH, JOHN ANTHONY. Complete Nucleotide Sequences of Two bla(KPC-2)-Bearing IncN Plasmids Isolated from Sequence Type 442 Klebsiella pneumoniae Clinical Strains Four Years Apart. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 58, n. 5, p. 2958-2960, MAY 2014. Citações Web of Science: 9.

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