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Fingerprinting dè proteínas E lipídeos pôr MALDI-MS Pará diferenciação intra-espécie dè isolados de Fusarium oxysporum f. SP. cubense

Processo: 13/11100-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de fevereiro de 2014
Vigência (Término): 04 de outubro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
Pesquisador responsável:Marcos Nogueira Eberlin
Beneficiário:Daniele Fernanda de Oliveira Rocha
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):15/25532-0 - PROTEÔMICA SHOTGUN DE ISOLADOS BRASILEIROS DE Fusarium oxysporum f. sp. cubense PARA ESTUDO DAS RELAÇÕES HOSPEDEIRO-PATÓGENO, BE.EP.PD
Assunto(s):Espectrometria de massas   Bananicultura

Resumo

Este projeto propõe a utilização de espectrometria de massas na análise de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense (FOC), fungo causador do mal-do-panamá em plantações de banana. Esta é uma das seis mais importantes doenças que atingem esta cultura, gerando grande impacto econômico (Ploetz, 2006), ocasionando a morte das plantas e impedindo novos plantios (Cordeiro & Matos, 2005). O método de controle mais recomendado é o uso de cultivares resistentes, o que faz necessária a avaliação genética do patógeno para o manejo da doença em longo prazo (Ploetz, 2006). FOC apresenta mais de oito diferentes linhagens filogenéticas que não são distinguíveis através de análise morfológica convencional, fazendo necessário o uso de técnicas alternativas para a sua completa caracterização, como o sequenciamento genético (Fourie et al., 2011). O objetivo deste projeto é a caracterização de isolados de FOC por espectrometria de massas de ionização e dessorção a laser assistida por matriz com analisador de tempo de vôo (MALDI-TOF-MS), visando à diferenciação intra-espécie através do fingerprinting de lipídeos e proteínas ribossomais Este é um método reconhecidamente prático, eficaz e de baixo custo para a identificação rápida de micro-organismos (Braga et al., 2013; Ahamad et al., 2012). O projeto será realizado em colaboração com o Pesquisador Me. Robert Harri Hinz (Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa Catarina - EPAGRI) e a Me. Cristiane Maria da Silva (Universidade Federal de Santa Catarina - UFSC). Os isolados a serem estudados já estão sendo caracterizados morfologica e geneticamente na EPAGRI e a comparação dos dados genéticos e químicos dará um panomarama mais detalhado da população de FOC na região estudada, contribuindo para o controle do mal-do-panamá e o maior entendimento da biologia do FOC.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
NEGRAO, FERNANDA; ABANADES, DANIEL R.; JAEEGER, CAROLINE F.; ROCHA, DANIELE F. O.; BELAZ, KATIA R. A.; GIORGIO, SELMA; EBERLIN, MARCOS N.; ANGOLINI, CELIO F. F. Lipidomic alterations of in vitro macrophage infection by L-infantum and L-amazonensis. MOLECULAR BIOSYSTEMS, v. 13, n. 11, p. 2401-2406, NOV 2017. Citações Web of Science: 3.
ROCHA, DANIELE F. O.; CUNHA, CRISTIANE M. S.; BELAZ, KATIA ROBERTA A.; DOS SANTOS, FABIO N.; HINZ, ROBERT H.; PEREIRA, ADRIANA; WICKET, ESTER; ANDRADE, LIDIANE M.; NASCIMENTO, CLAUDIO A. O.; VISCONTI, ALEXANDRE; EBERLIN, MARCOS N. Lipid and protein fingerprinting for Fusarium oxysporum f. sp cubense strain-level classification. ANALYTICAL AND BIOANALYTICAL CHEMISTRY, v. 409, n. 29, p. 6803-6812, NOV 2017. Citações Web of Science: 0.
JAEGGER, C. F.; NEGRAO, F.; ASSIS, D. M.; BELAZ, K. R. A.; ANGOLINI, C. F. F.; FERNANDES, A. M. A. P.; SANTOS, V. G.; PIMENTEL, A.; ABANADES, D. R.; GIORGIO, S.; EBERLIN, M. N.; ROCHA, D. F. O. MALDI MS imaging investigation of the host response to visceral leishmaniasis. MOLECULAR BIOSYSTEMS, v. 13, n. 10, p. 1946-1953, OCT 2017. Citações Web of Science: 2.

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