Prospecção e caracterização de serino peptidases carboxílicas e glutâmico peptidases de bactérias isoladas a partir do sistema de compostagem do Zoológico de São Paulo.

• Processo: 13/12106-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Enzimologia
• Pesquisador responsável: Maria Aparecida Juliano
• Beneficiário: Márcia Yuri Kondo
• Instituição Sede: Instituto Nacional de Farmacologia (INFAR). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 12/50191-4 - Síntese, estudo cinético e aplicações de substratos e inibidores de enzimas proteolíticas, AP.TEM
• Assunto(s): Peptídeo hidrolases Bactérias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bacteria | glutamico peptidases | prospecção de proteases | proteases carboxilicas | serino peptidases carboxilicas | Substratos FRET | proteases

Resumo

As enzimas proteolíticas estão amplamente distribuídas em todos os organismos e desempenham diversas funções essenciais a estes. Atualmente são reconhecidos sete grupos de proteases (serino-, cisteíno-, aspártico-, metalo-, treonino-, glutâmico peptidases e asparagino peptídeo liases) que são classificados de acordo com o seu mecanismo catalítico. Dentre as proteases carboxílicas que atuam em pH ácido, as principais são: aspártico peptidases, serino peptidases carboxílicas e glutâmico peptidases. Enquanto as aspártico peptidases são amplamente conhecidas e estudadas, os outros dois grupos de proteases carboxílicas são relativamente novos e ainda pouco estudados. As serino peptidases carboxílicas apresentam um único domínio com configuração do tipo subtilisina e tríade catalítica composta pelas cadeias laterais de serina, ácido glutâmico e ácido aspártico (S-E-D), sendo encontradas em diversos organismos, principalmente em bactérias. Já as glutâmico peptidases apresentam díade catalítica formada por ácido glutâmico e glutamina (E-Q) e estrutura única entre as proteases formada por um b-sanduíche de folhas b antiparalelas. A maioria das glutâmico peptidases conhecidas até o momento foram isoladas de fungos e apesar de existirem também em bactérias foram ainda pouco exploradas nestas. Neste projeto, pretende-se prospectar, isolar e caracterizar novas serino peptidases carboxílicas e glutâmico peptidases explorando as coleções de bactérias que crescem em pH ácido, isoladas a partir do processo de compostagem do Zoológico de São Paulo, bem como realizar a expressão recombinante destas proteases. A descoberta de novas proteases destes grupos em bactérias irá prover informações básicas importantes sobre estas enzimas e também suas possíveis aplicações biotecnológicas.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

RAMOS, PATRICIA L.; KONDO, MARCIA Y.; SANTOS, SAARA M. B.; DE VASCONCELLOS, SUZAN P.; ROCHA, RAFAEL C. S.; DA CRUZ, JOAO B.; EUGENIO, PATRICIA F. M.; CABRAL, HAMILTON; JULIANO, MARIA A.; JULIANO, LUIZ; et al. A Tropical Composting Operation Unit at SAo Paulo Zoo as a Source of Bacterial Proteolytic Enzymes. Applied Biochemistry and Biotechnology, v. 187, n. 1, p. 282-297, JAN 2019. (14/07037-0, 12/50191-4, 13/12106-8, 11/06548-2)

KONDO, MARCIA Y.; GOUVEA, IURI E.; OKAMOTO, DEBORA N.; SANTOS, JORGE A. N.; SOUCCAR, CADEN; ODA, KOHEI; JULIANO, LUIZ; JULIANO, MARIA A.. Analysis of catalytic properties of tripeptidyl peptidase I (TTP-I), a serine carboxyl lysosomal protease, and its detection in tissue extracts using selective FRET peptide substrate. Peptides, v. 76, p. 80-86, FEB 2016. (13/12106-8, 12/50191-4)