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Filogeografia comparada de plantas na Amazônia Central

Processo: 13/12633-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de outubro de 2013
Vigência (Término): 23 de março de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Lúcia Garcez Lohmann
Beneficiário:Alison Gonçalves Nazareno
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:12/50260-6 - Estruturação e evolução da biota amazônica e seu ambiente: uma abordagem integrativa, AP.BTA.TEM
Bolsa(s) vinculada(s):17/02302-5 - Cruzando os rios amazônicos: um estudo comparativo entre plantas com distintas histórias de vida, BE.EP.PD   15/07141-4 - Testando a hipótese dos rios como barreira biogeográfica para espécies de plantas da Amazônia, BE.EP.PD
Assunto(s):Sequenciamento de nova geração   Estruturas genéticas   Filogeografia   Polimorfismo de um único nucleotídeo

Resumo

A Amazônia representa um dos Biomas mais diversos no Planeta. Apesar disso, pouco ainda se sabe sobre os processos ecológicos e evolutivos que levaram às altas taxas de diversificação, manutenção e distribuição das espécies nesta região. Dada a magnitude deste Bioma, estudos de caso, como o de organismos que apresentam padrões de distribuição fragmentada, formando ilhas na paisagem, são ideais para testar hipóteses sobre os mecanismos ecológicos e evolutivos envolvidos na origem de distribuições disjuntas. O gênero Pagamea (Rubiaceae), por exemplo, apresenta espécies que se distribuem em habitats específicos (campinas e campinaranas) representando um excelente modelo para estudos populacionais. Usando a técnica de sequenciamento massivo de sequências associadas a sítios de restrição (RAD-seq, Restriction site Associated DNA sequencing) para identificar marcadores SNPs (Single Nucleotide Polimorphism), determinaremos a história filogeográfica de P. coriacea. Para elucidá-la, serão testadas as hipóteses associadas à grandes rios como possíveis barreiras geográficas, bem como hipóteses associadas ao papel da distribuição espacial das campinaranas de diferentes tamanhos e padrões de isolamento geográfico na diferenciação genética entre as populações de P. coriacea. O padrão e o tempo de divergência filogenética entre populações de P. coriacea também serão inferidos, explorando o potencial de diferenciação adaptativa. Este projeto de pesquisa está vinculado ao projeto "Estruturação e Evolução da Biota Amazônica e seu ambiente: Uma abordagem integrativa" (FAPESP: 2012/50260-6).

Publicações científicas (6)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
NAZARENO, ALISON G.; DICK, CHRISTOPHER W.; LOHMANN, LUCIA G. Tangled banks: A landscape genomic evaluation of Wallace's Riverine barrier hypothesis for three Amazon plant species. Molecular Ecology, v. 28, n. 5, p. 980-997, MAR 2019. Citações Web of Science: 0.
NAZARENO, ALISON G.; BEMMELS, JORDAN B.; DICK, CHRISTOPHER W.; LOHMANN, LUCIA G. Minimum sample sizes for population genomics: an empirical study from an Amazonian plant species. MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES, v. 17, n. 6, p. 1136-1147, NOV 2017. Citações Web of Science: 35.
BEYER, MAILA; NAZARENO, ALISON G.; LOHMANN, LUIA G. USING GENOMIC DATA TO DEVELOP CHLOROPLAST DNA SSRS FOR THE NEOTROPICAL LIANA STIZOPHYLLUM RIPARIUM (BIGNONIEAE, BIGNONIACEAE). APPLICATIONS IN PLANT SCIENCES, v. 5, n. 10 OCT 2017. Citações Web of Science: 0.
NAZARENO, ALISON G.; DICK, CHRISTOPHER W.; LOHMANN, LUCIA G. Wide but not impermeable: Testing the riverine barrier hypothesis for an Amazonian plant species. Molecular Ecology, v. 26, n. 14, p. 3636-3648, JUL 2017. Citações Web of Science: 10.
FRANCISCO, JESSICA N. C.; NAZARENO, ALISON G.; LOHMANN, LUCIA G. A GENOMIC APPROACH FOR ISOLATING CHLOROPLAST MICROSATELLITE MARKERS FOR PACHYPTERA KERERE (BIGNONIACEAE). APPLICATIONS IN PLANT SCIENCES, v. 4, n. 9 SEP 2016. Citações Web of Science: 1.
NAZARENO, ALISON GONCALVES; CARLSEN, MONICA; LOHMANN, LUCIA GARCEZ. Complete Chloroplast Genome of Tanaecium tetragonolobum: The First Bignoniaceae Plastome. PLoS One, v. 10, n. 6 JUN 23 2015. Citações Web of Science: 29.

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