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Associação entre coeficientes de endogamia genômicos e características reprodutivas em bovinos da raça Nelore

Processo: 13/15869-2
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2013
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2014
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Reprodução Animal
Pesquisador responsável:José Fernando Garcia
Beneficiário:Ludmilla Balbo Zavarez
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):13/26269-6 - Associação entre coeficientes de endogamia genômicos e características reprodutivas em bovinos da raça Nelore, BE.EP.MS
Assunto(s):Endogamia   Bovinos   Gado Nelore   Genômica   Polimorfismo de um único nucleotídeo

Resumo

A endogamia tem sido apontada como uma das causas de redução no desempenho reprodutivo em bovinos. Essa relação negativa é conhecida como 'depressão por endogamia', e as evidências que sustentam essa hipótese provêm de estudos de associação entre medidas reprodutivas e estimativas do coeficiente de endogamia (F). Classicamente, o coeficiente de endogamia tem sido calculado a partir de dados de pedigree (FPED), entretanto esse tipo de informação é suscetível a erro e frequentemente encontra-se incompleta. Com o surgimento de microarranjos de DNA capazes de determinar o perfil genotípico de centenas de milhares de polimorfismos de sítio único (SNP - Single Nucleotide Polymorphism) por todo o genoma, vem sendo possível a obtenção de estimativas mais robustas dos níveis de endogamia a partir da informação genômica por meio de método capaz de identificar corridas de homozigosidade (ROH - Runs of Homozygosity). O objetivo deste trabalho consistirá da análise de associação entre os coeficientes de endogamia genômico (FROH) e valores genéticos estimados (Estimated Breeding Values) para Circunferência Escrotal (CE), Idade ao Primeiro Parto (IPP) e Duração da Gestação (DG) em bovinos da raça Nelore. Serão utilizados dados provenientes de cerca de 2.300 animais da raça Nelore (em torno de 1.000 touros e 1.300 vacas) participantes de programa de melhoramento genético e que foram analisados para 777.962 SNP no ensaio Bovine HD (Illumina). Corridas de homozigosidade (ROH) serão identificadas para cada indivíduo utilizando o software SNP & Variation Suite (Golden Helix) e os níveis de autozigosidade individuais serão associados aos fenótipos empregando modelo linear misto ponderado, objetivando identificar regiões do genoma que influenciam a manifestação de características reprodutivas em bovinos. Termos-chave: Bovino, Nelore, Endogamia, Genômica, SNP, ROH.

Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
ZAVAREZ, Ludmilla Balbo. Avaliação da autozigosidade em vacas Nelore (Bos indicus) através de genótipos SNP de alta densidade. 2014. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias..

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