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Análise do transcriptoma de Trichophyton rubrum: estrutura, expressão e regulação gênica envolvidas com a patogenicidade

Processo: 13/19195-6
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 06 de janeiro de 2014
Vigência (Término): 05 de maio de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Nilce Maria Martinez-Rossi
Beneficiário:Gabriela Felix Persinoti
Supervisor no Exterior: Christina Cuomo
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto, SP, Brasil
Local de pesquisa : Broad Institute, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:12/22232-8 - Identificação de RNAs não codificantes e avaliação de seu envolvimento na patogenicidade do dermatófito Trichophyton rubrum, BP.PD
Assunto(s):Biologia computacional   Regulação da expressão gênica   Trichophyton   Arthrodermataceae

Resumo

Os dermatófitos são um grupo filogeneticamente relacionados de fungos filamentosos capazes de invadir e colonizar tecidos queratinizados de humanos e animais. Estas espécies podem ser classificadas como geofílicos, zoofílicos e antropofílicos, de acordo com seu habitat preferencial, como o solo, animais e humanos, respectivamente. O genoma de sete espécies de dermatófitos foi recentemente sequenciado e análises de genômica comparativa demonstraram que estas espécies apresentam poucas diferenças entre os seus genes e na organização de seus genomas, apresentando um elevado grau de colinearidade e relativamente poucos genes específicos de cada espécie. Embora haja uma elevada semelhança, cada espécies é adaptada a um hospedeiro específico. Esta especificidade nicho pode estar relacionada a regulação diferencial por cada espécies de fatores de virulência, que podem ser resultante da interação de diversos componentes da célula, tais como proteínas, DNA, RNA e também pequenas moléculas, tais como RNAs não-codificantes (ncRNAs) . A proposta deste projeto é avaliar o transcriptoma da espécie antropofílica Trichophyton rubrum com o objetivo de construir uma rede de regulação gênica, a fim de identificar genes relacionados à patogenicidade. Propõe-se também a identificação de ncRNAs e os sítios de início de transcrição de genes de T. rubrum que podem revelar informações importantes sobre a estrutura e mecanismos de regulação gênica neste organismo, revelando mecanismos ainda não conhecidos. Os resultados obtidos fornecerão informações mais detalhadas sobre a estrutura de genes e do genoma, além de perfis transcricionais relacionados à patogenicidade deste organismo, que será de grande valor para a comunidade que trabalha com dermatófitos, revelando aspectos interessantes da patogenicidade de T. rubrum. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
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