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Análise do transcriptoma de Trichophyton rubrum: estrutura, expressão e regulação gênica envolvidas com a patogenicidade

Processo: 13/19195-6
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 06 de janeiro de 2014
Vigência (Término): 05 de maio de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Nilce Maria Martinez-Rossi
Beneficiário:Gabriela Felix Persinoti
Supervisor no Exterior: Christina Cuomo
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Local de pesquisa : Broad Institute, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:12/22232-8 - Identificação dè RNAs não codificantes e avaliação dè seu envolvimento ná patogenicidade dò dermatófito Trichophyton rubrum, BP.PD
Assunto(s):Biologia computacional   Regulação da expressão gênica   Trichophyton   Arthrodermataceae

Resumo

Os dermatófitos são um grupo filogeneticamente relacionados de fungos filamentosos capazes de invadir e colonizar tecidos queratinizados de humanos e animais. Estas espécies podem ser classificadas como geofílicos, zoofílicos e antropofílicos, de acordo com seu habitat preferencial, como o solo, animais e humanos, respectivamente. O genoma de sete espécies de dermatófitos foi recentemente sequenciado e análises de genômica comparativa demonstraram que estas espécies apresentam poucas diferenças entre os seus genes e na organização de seus genomas, apresentando um elevado grau de colinearidade e relativamente poucos genes específicos de cada espécie. Embora haja uma elevada semelhança, cada espécies é adaptada a um hospedeiro específico. Esta especificidade nicho pode estar relacionada a regulação diferencial por cada espécies de fatores de virulência, que podem ser resultante da interação de diversos componentes da célula, tais como proteínas, DNA, RNA e também pequenas moléculas, tais como RNAs não-codificantes (ncRNAs) . A proposta deste projeto é avaliar o transcriptoma da espécie antropofílica Trichophyton rubrum com o objetivo de construir uma rede de regulação gênica, a fim de identificar genes relacionados à patogenicidade. Propõe-se também a identificação de ncRNAs e os sítios de início de transcrição de genes de T. rubrum que podem revelar informações importantes sobre a estrutura e mecanismos de regulação gênica neste organismo, revelando mecanismos ainda não conhecidos. Os resultados obtidos fornecerão informações mais detalhadas sobre a estrutura de genes e do genoma, além de perfis transcricionais relacionados à patogenicidade deste organismo, que será de grande valor para a comunidade que trabalha com dermatófitos, revelando aspectos interessantes da patogenicidade de T. rubrum. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Study investigates the reproductive habits of the fungus that causes athlete’s foot 
Grupo da USP investiga hábitos reprodutivos do fungo causador do pé de atleta 

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
PERSINOTI, GABRIELA F.; MARTINEZ, DIEGO A.; LI, WENJUN; DOGEN, AYLIN; BILLMYRE, R. BLAKE; AVERETTE, ANNA; GOLDBERG, JONATHAN M.; SHEA, TERRANCE; YOUNG, SARAH; ZENG, QIANDONG; OLIVER, BRIAN G.; BARTON, RICHARD; METIN, BANU; HILMIOGLU-POLAT, SULEYHA; ILKIT, MACIT; GRASER, YVONNE; MARTINEZ-ROSSI, NILCE M.; WHITE, THEODORE C.; HEITMAN, JOSEPH; CUOMO, CHRISTINA A. Whole-Genome Analysis Illustrates Global Clonal Population Structure of the Ubiquitous Dermatophyte Pathogen Trichophyton rubrum. Genetics, v. 208, n. 4, p. 1657-1669, APR 2018. Citações Web of Science: 11.

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