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Identificação de uma t1PKS-transAT PKS-NRPS em Streptomyces sp. via genome mining

Processo: 13/12598-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2013
Vigência (Término): 31 de julho de 2015
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
Pesquisador responsável:Luciana Gonzaga de Oliveira
Beneficiário:Renata Sigrist
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Streptomyces   Expressão heteróloga

Resumo

Os policetídeos complexos e os peptídeos não-ribossomais destacam-se por combinar a alta complexidade estrutural a uma ampla gama de atividades terapêuticas. A produção destes metabólitos tem sido observada em inúmeros organismos, entretanto, as actinobactérias cultiváveis são certamente os produtores mais prolíficos e versáteis destas classes de metabólitos. Em especial, no caso das actinobactérias, a enzimologia do arranjo linear das policetídeo sintases (PKSs) e das peptídeo não-ribossomal sintetases (NRPSs) é razoavelmente bem estabelecida. Com o avanço das metodologias de sequenciamento e disponibilidade de ferramentas de bioinformática é possível mapear a presença de genes biossintéticos que codificam para essas e outras classes de enzimas e complexos multienzimáticos de forma a estimar o potencial do maquinário enzimático envolvido na biossíntese de metabólitos secundários. A versatilidade desta ferramenta conhecida por genome mining permite a busca por novos alvos terapêuticos.Neste estudo estamos propondo a construção e triagem de uma biblioteca PAC de clones de uma linhagem endofítica Streptomyces sp para a caracterização do grupo de genes envolvido na síntese de um suposto metabólito originado por ação conjunta de PKS do tipo 1, trans AT PKS e NRPS. O cluster será transferido para heterólogo (S. coelicolor e S. lividans) e a produção heteróloga será avaliada.

Publicações científicas (8)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SIGRIST, RENATA; PAULO, BRUNO S.; ANGOLINI, CELIO F. F.; DE OLIVEIRA, LUCIANA G. Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products. JOVE-JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTS, n. 157 MAR 2020. Citações Web of Science: 0.
PAULO, BRUNO S.; SIGRIST, RENATA; ANGOLINI, CELIO F. F.; DE OLIVEIRA, LUCIANA G. New Cyclodepsipeptide Derivatives Revealed by Genome Mining and Molecular Networking. CHEMISTRYSELECT, v. 4, n. 27, p. 7785-7790, JUL 23 2019. Citações Web of Science: 1.
BRUNO S. PAULO; RENATA SIGRIST; CÉLIO F. F. ANGOLINI; MARCOS N. EBERLIN; LUCIANA G. DE OLIVEIRA. Gene Deletion Leads to Improved Valinomycin Production by Streptomyces sp. CBMAI 2042. Journal of the Brazilian Chemical Society, v. 30, n. 3, p. 673-679, Mar. 2019.
PAULO, BRUNO S.; SIGRIST, RENATA; ANGOLINI, CELIO F. F.; EBERLIN, MARCOS N.; DE OLIVEIRA, LUCIANA G. Gene Deletion Leads to Improved Valinomycin Production by Streptomyces sp. CBMAI 2042. Journal of the Brazilian Chemical Society, v. 30, n. 3, SI, p. 673-679, MAR 2019. Citações Web of Science: 2.
BRUNO S. PAULO; RENATA SIGRIST; LUCIANA G. DE OLIVEIRA. AVANÇOS RECENTES EM BIOSSÍNTESE COMBINATÓRIA DE POLICETÍDEOS: PERSPECTIVAS E DESAFIOS. Química Nova, v. 42, n. 1, p. 71-83, Jan. 2019.
DE OLIVEIRA, LUCIANA GONZAGA; SIGRIST, RENATA; PAULO, BRUNO SACHETTO; SAMBORSKYY, MARKYIAN. Whole-Genome Sequence of the Endophytic Streptomyces sp. Strain CBMAI 2042, Isolated from Citrus sinensis. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 8, n. 2 JAN 2019. Citações Web of Science: 1.
CÉLIO F. F. ANGOLINI; ANA B. GONÇALVES; RENATA SIGRIST; BRUNO S. PAULO; MARKIYAN SAMBORSKYY; PEDRO L. R. CRUZ; ADRIANA F. VIVIAN; EDUARDO M. SCHMIDT; MARCOS N. EBERLIN; WELINGTON L. ARAÚJO; LUCIANA G. DE OLIVEIRA. Genome Mining of Endophytic Streptomyces wadayamensis Reveals High Antibiotic Production Capability. Journal of the Brazilian Chemical Society, v. 27, n. 8, p. 1465-1475, Ago. 2016.
SIGRIST, RENATA; DA COSTA, BRUNA ZUCOLOTO; MARSAIOLI, ANITA JOCELYNE; DE OLIVEIRA, LUCIANA GONZAGA. Nature-inspired enzymatic cascades to build valuable compounds. BIOTECHNOLOGY ADVANCES, v. 33, n. 5, SI, p. 394-411, SEP-OCT 2015. Citações Web of Science: 18.

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