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Diversidade bacteriana em lagoas salino-alcalinas do Pantanal da Nhecolândia-MS

Processo: 13/20142-4
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2013
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2015
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia
Pesquisador responsável:Marli de Fátima Fiore
Beneficiário:Gabriela Machineski da Silva
Instituição-sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Assunto(s):Filogenia   Ecologia microbiana

Resumo

As lagoas salino-alcalinas (salinas) do Pantanal da Nhecolândia, Mato Grosso do Sul (MS), são consideradas ambientes extremos devido aos elevados valores de pH e altas concentrações de sal. Considerando as poucas informações relacionadas à composição da diversidade de micro-organismos dessas lagoas, este plano de pesquisa visa gerar informações sobre a diversidade bacteriana em lagoas salino-alcalinas do Pantanal da Nhecolândia-MS, Brasil. Amostras de água foram coletadas em duas salinas distintas na região da Nhecolândia, as quais diferem quanto à presença ou não de florações ao longo do ano. A primeira salina, denominada Salina Verde se caracteriza por apresentar florações constantes de microalgas e cianobactérias e na segunda, denominada Salina Preta, este fenômeno nunca ocorre. As coletas foram realizadas em duas profundidades (superfície e fundo) e em dois períodos ao longo do dia. O DNA das amostras será extraído e os grupos bacterianos presentes nesse ambiente e a variação da composição dessas comunidades serão acessadas por meio do pirossequenciamento do gene codificador do RNAr 16S. Análises de PCR quantitativo dos genes rRNA 16S e nifH serão realizadas com o objetivo de quantificar, respectivamente, a comunidade bacteriana e diazotrófica presentes. Tais dados permitirão analisar a predominância da comunidade cianobacteriana, diazotrófica ou não, em relação à comunidade bacteriana total. Ainda, serão avaliados, por PCR, clonagem e sequenciamento, genes envolvidos nos ciclos dos elementos arsênio, mercúrio e selênio, os quais são comumente encontrados nas salinas. Esse estudo contribuirá para o conhecimento da diversidade microbiana e entendimento de processos biogeoquímicos em lagoas salino-alcalinas do Pantanal da Nhecolânida-MS.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ANDREOTE, ANA P. D.; DINI-ANDREOTE, FRANCISCO; RIGONATO, JANAINA; MACHINESKI, GABRIELA SILVA; SOUZA, BRUNO C. E.; BARBIERO, LAURENT; REZENDE-FILHO, ARY T.; FIORE, MARLI F. Contrasting the Genetic Patterns of Microbial Communities in Soda Lakes with and without Cyanobacterial Bloom. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 9, FEB 22 2018. Citações Web of Science: 3.
HECK, KARINA; MACHINESKI, GABRIELA SILVA; ALVARENGA, DANILLO OLIVEIRA; MARCAL VIEIRA VAZ, MARCELO GOMES; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO; FIORE, MARLI FATIMA. Evaluating methods for purifying cyanobacterial cultures by qPCR and high-throughput Illumina sequencing. Journal of Microbiological Methods, v. 129, p. 55-60, OCT 2016. Citações Web of Science: 6.

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