Caracterização estrutural de complexos membranários envolvidos na síntese da parede celular bacteriana

• Processo: 13/22681-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2014
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2017
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Andrea Dessen de Souza e Silva
• Beneficiário: Lucas Mayrink Assis
• Instituição Sede: Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/52067-6 - Estruturação de complexos macromoleculares da parede bacteriana: biossíntese e virulência, AP.SPEC
• Bolsa(s) vinculada(s): 15/20278-9 - Caracterização estrutural de um complexo de proteínas de membrana envolvido na síntese da parede celular bacteriana, BE.EP.DD
• Assunto(s): Proteínas de transporte Parede celular Peptidoglicano
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Complexos entre flippases e penicillin binding proteins | parede celular bacteriana | síntese do peptideoglicano | Translocação do lipídeo II | proteínas

Resumo

A parede celular desempenha função essencial na manutenção da sobrevivência bacteriana, prevenindo a lise osmótica e conferindo rigidez e formato à célula. As enzimas envolvidas na biossíntese de seu componente central, o peptideoglicano, há muitos anos são utilizadas como alvos de antibióticos. Porém, o número crescente de cepas resistentes traz a necessidade do estudo e da caracterização de novos alvos moleculares. Neste sentido, o objetivo desse trabalho é caracterizar estruturalmente os complexos formados entre flippases e PBPs, proteínas essenciais para a síntese do peptideoglicano, assim como as flippases complexadas a inibidores. A resolução das estruturas atômicas dessas proteínas auxiliará no desenvolvimento de fármacos e também permitirá um melhor entendimento bioquímico da síntese da parede celular. As metodologias utilizadas para alcançar esses objetivos incluem a expressão e a purificação das proteínas, além de experimentos de cristalografia efetuados no síncrotron do LNLS em Campinas. Adicionalmente, será utilizada a biblioteca de compostos do LNBio na busca de novos inibidores para as flippases. O projeto temático intitulado "Estruturação de complexos macromoleculares da parede celular bacteriana", dirigido pela Andréa Dessen, compreende um laboratório no Laboratório Nacional de Biociências (LNBio), em Campinas-SP, com quatro pesquisadores, e um laboratório no Institut de Biologie Structurale (IBS), em Grenoble, na França, com 10 pesquisadores. O grupo conta ainda com a colaboração do laboratório do Dr. Eefjan Breukink, em Utrecht, na Holanda. O candidato realizará a maior parte do trabalho de doutoramento no LNBio, porém, devido à larga experiência dos pesquisadores de Grenoble na cristalização de proteínas de membrana, consideramos que o aluno adquirirá bastante experiência realizando algumas etapas do projeto em Grenoble. Os resultados obtidos com este estudo, permitirão uma melhor compreensão da síntese do peptideoglicano e de como ela se inter-relaciona com outras etapas do ciclo de vida bacteriano. Além disso, o conhecimento da estrutura das proteínas permitirá que novos alvos moleculares sejam utilizados como antimicrobianos. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ASSIS, L. MAYRINK; NEDELJKOVIC, M.; DESSEN, A.. New strategies for targeting and treatment of multi-drug resistant Staphylococcus aureus. DRUG RESISTANCE UPDATES, v. 31, p. 1-14, MAR 2017. (13/22681-0, 11/52067-6)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

ASSIS, Lucas Mayrink. Caracterização estrutural e funcional de proteínas de membrana envolvidas na síntese do peptideoglicano. 2017. Tese de Doutorado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.