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Associação entre coeficientes de endogamia genômicos e características reprodutivas em bovinos da raça Nelore

Processo: 13/26269-6
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
Vigência (Início): 14 de fevereiro de 2014
Vigência (Término): 13 de junho de 2014
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Reprodução Animal
Pesquisador responsável:José Fernando Garcia
Beneficiário:Ludmilla Balbo Zavarez
Supervisor no Exterior: Tad Stewart Sonstegard
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Local de pesquisa : Beltsville Agricultural Research Center, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:13/15869-2 - Associação entre coeficientes de endogamia genômicos e características reprodutivas em bovinos da raça Nelore, BP.MS
Assunto(s):Genômica   Endogamia   Bovinos

Resumo

ASSOCIAÇÃO ENTRE COEFICIENTES DE ENDOGAMIA GENÔMICOS E CARACTERÍSTICAS REPRODUTIVAS EM BOVINOS DA RAÇA NELORE A endogamia tem sido apontada como uma das causas de redução no desempenho reprodutivo em bovinos. Essa relação negativa é conhecida como 'depressão por endogamia', e as evidências que sustentam essa hipótese provêm de estudos de associação entre medidas reprodutivas e estimativas do coeficiente de endogamia (F). Classicamente, o coeficiente de endogamia tem sido calculado a partir de dados de pedigree (FPED), entretanto esse tipo de informação é suscetível a erro e frequentemente encontra-se incompleta. Com o surgimento de microarranjos de DNA capazes de determinar o perfil genotípico de centenas de milhares de polimorfismos de sítio único (SNP - Single Nucleotide Polymorphism) por todo o genoma, vem sendo possível a obtenção de estimativas mais robustas dos níveis de endogamia a partir da informação genômica por meio de método capaz de identificar corridas de homozigosidade (ROH - Runs of Homozygosity). O presente projeto visa buscar associações entre coeficientes de endogamia genômico (FROH) e fenótipos ajustados para Idade ao Primeiro Parto (IPP) e Duração da Gestação (DG) em bovinos da raça Nelore, utilizando dados de mais de 2.000 amostras de Nelore genotipados para mais de 777 mil SNPs. Corridas de homozigosidade (ROH) serão identificadas para cada indivíduo utilizando o software SNP & Variation Suite (Golden Helix) e os níveis de autozigosidade individuais serão associados aos fenótipos empregando modelo linear misto ponderado, objetivando identificar regiões do genoma que influenciam a manifestação de características reprodutivas em bovinos. (AU)

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