Análise genômica comparativa de escherichia coli extra-instestinal de origem humana e aviária

• Processo: 13/25615-8
• Linha de fomento: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de abril de 2014
• Vigência (Término): 31 de março de 2015
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Medicina Veterinária Preventiva
• Pesquisador responsável: Wanderley Dias da Silveira
• Beneficiário: Renato Pariz Maluta
• Supervisor no Exterior: Lisa Kay Nolan
• Instituição-sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Local de pesquisa: Iowa State University, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 12/05073-3 - Caracterização molecular de linhagens de escherichia coli patogênicas para aves (apec) e uropatogênicas (upec) para humanos, BP.PD
• Assunto(s): Escherichia coli Microbiologia

Resumo

Avian pathogenic Escherichia coli (APEC) strains are agents of significant degrees of morbidity and mortality in broilers and laying hens, causing losses to the poultry industry worldwide. Furthermore, APEC strains have been suggested to play a role as potential zoonotic agents. In this project, we aim to assemble the genomes of APEC and human extra-intestinal pathogenic (ExPEC) strains, studied during the Posdoctoral project (FAPESP 2012/05073-3). The assembling will allow comparisons between the core and accessory genomes. Pathogenicity islands (PAIs), will be detected in silico. Phylogenomics will be compared with the MLST and ECOR typing, which were performed under the framework of the 2012/05073-3 project. The comparisons between APEC and human ExPEC may demonstrate remarkable similarities, regarding the phylogenetic background and virulence traits. These similarities may indicate new overlapped characteristics between APEC and human ExPEC, reinforcing or demonstrating the zoonotic potential of a subset of APEC strains. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MALUTA, RENATO P.; NICHOLSON, BRYON; LOGUE, CATHERINE M.; NOLAN, LISA K.; ROJAS, THAIS C. G.; DA SILVEIRA, WANDERLEY DIAS. Complete Genomic Sequence of an Avian Pathogenic Escherichia coli Strain of Serotype O7:HNT. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 4, n. 1 JAN-FEB 2016. Citações Web of Science: 1.