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Metagenoma das comunidades microbianas envolvidas no ciclo do nitrogênio em solos de cana de açúcar no Brasil

Processo: 13/26993-6
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Vigência (Início): 19 de maio de 2014
Vigência (Término): 18 de outubro de 2014
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Ciência do Solo
Pesquisador responsável:Fernando Dini Andreote
Beneficiário:Júlia Elidia de Lima Perim
Supervisor no Exterior: Romy Chakraborty
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Local de pesquisa : Lawrence Berkeley National Laboratory, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:12/03949-9 - Diversidade microbiana envolvida na ciclagem do nitrogênio em solos de cultivo de cana-de-açúcar no Estado de São Paulo, BP.DR
Assunto(s):Archaea   DNA   Ecologia microbiana

Resumo

O cultivo da cana-de-açúcar ocupa cerca de 5 milhões de hectares no estado de São Paulo e é uma cultura de grande impacto na agricultura brasileira . Considerando-se sua produtividade e sustentabilidade, uma melhor compreensão da composição microbiana dos solos utlizados para o cultivo da cana de açúcar, bem como o papel que os microrganismos envolvidos no ciclo do nitrogênio (N) desempenham é de extrema importância, uma vez que são responsáveis pela disponibilidade deste elemento às plantas. No entanto, pouco se sabe sobre estas comunidades microbianas em canaviais brasileiros e as nossas áreas de amostragem, pela primeira vez, oferecem uma gama de diferentes condições de manejo e características. A técnica de sequenciamento do metagenoma por shotgun permite detectar organismos que existem em abundância muito baixa nas populações complexas e, consequentemente, a capacidade de detectá-las pode afetar profundamente a interpretação de mudanças microbiológicas no ambiente. Finalmente, neste trabalho propomos a utilização de dados de metagenômica, que permitem a investigação destes grupos microbianos, além da visão completa da composição das comunidades relacionadas ao ciclo do nitrogênio, as quais são extremamente importantes para o sistema solo. Os dados de metagenômica servirão de base para análises estatísticas multivariadas, relacionando os metadados com outros dados já obtidos até o presente momento no projeto de doutorado. (AU)