Análise funcional de promotores de cana-de-açúcar e sua variação alélica

• Processo: 13/23048-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de março de 2014
• Vigência (Término): 31 de outubro de 2015
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Acordo de Cooperação: FAPEMIG
• Pesquisador responsável: Glaucia Mendes Souza
• Beneficiário: Sávio de Siqueira Ferreira
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 08/52146-0 - Sugarcane signaling and regulatory networks, AP.BIOEN.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 14/22849-0 - Desenvolvimento de um sistema de expressão transiente para caracterização funcional de promotores de cana-de-açúcar, BE.EP.PD
• Assunto(s): Cana-de-açúcar
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Promotores | cana-de-açúcar

Resumo

A cana-de-açúcar é uma gramínea C4 usada por séculos como a principal fonte de açúcar e mais recentemente para obtenção de etanol. Devido a sua grande importância no cenário econômico mundial, estudos em cana-de-açúcar são cada vez mais importantes no sentido de prover informações que possam levar ao aumento de produtividade para suprir tanto a demanda interna quanto externa. A genômica em cana-de-açúcar é uma ciência engatinhando perto do conhecimento de espécies similares como sorgo, milho e arroz. O início dos estudos ocorreu com o projeto SUCEST e continua se expandindo nas atividades do projeto SUCEST-FUN e do sequenciamento do genoma da cana em andamento. No entanto, como sabido de outros organismos, o sequenciamento resolverá apenas parte de um problema maior, e será necessário começar a desvendar as complexas redes regulatórias da cana-de-açúcar, fornecendo dados de vias de regulação e conseqüências de sua alteração. O presente projeto insere-se neste contexto e visa analisar os dados gerados pelo projeto de sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar para estabelecer a arquitetura das redes regulatórias assim como identificar regiões regulatórias no genoma da cana. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FERREIRA, SAVIO SIQUEIRA; HOTTA, CARLOS TAKESHI; DE CARLI POELKING, VIVIANE GUZZO; COELHO LEITE, DEBORA CHAVES; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA; LOUREIRO, MARCELO EHLERS; PEREIRA BARBOSA, MARCIO HENRIQUE; CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO; SOUZA, GLAUCIA MENDES. Co-expression network analysis reveals transcription factors associated to cell wall biosynthesis in sugarcane. Plant Molecular Biology, v. 91, n. 1-2, p. 15-35, MAY 2016. (08/52146-0, 13/23048-9)

SOUZA, GLAUCIA MENDES; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI; LEE, HAYAN; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES; HOTTA, CARLOS TAKESHI; GAIARSA, JONAS WEISSMANN; DINIZ, AUGUSTO LIMA; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS; FERREIRA, SAVIO DE SIQUEIRA; et al. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GIGASCIENCE, v. 8, n. 12, DEC 2019. (13/07467-1, 13/18322-4, 17/02842-0, 08/52074-0, 14/50921-8, 15/22993-7, 12/51062-3, 17/02270-6, 11/50761-2, 16/17545-8, 16/06917-1, 13/23048-9, 08/52146-0, 15/15346-5)