Análise funcional de promotores de cana-de-açúcar e sua variação alélica

• Processo: 13/23048-9
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de março de 2014
• Vigência (Término): 31 de outubro de 2015
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Convênio/Acordo: FAPEMIG
• Pesquisador responsável: Glaucia Mendes Souza
• Beneficiário: Sávio de Siqueira Ferreira
• Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 08/52146-0 - Sugarcane signaling and regulatory networks, AP.BIOEN.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 14/22849-0 - Desenvolvimento de um sistema de expressão transiente para caracterização funcional de promotores de cana-de-açúcar, BE.EP.PD
• Assunto(s): Cana-de-açúcar

Resumo

A cana-de-açúcar é uma gramínea C4 usada por séculos como a principal fonte de açúcar e mais recentemente para obtenção de etanol. Devido a sua grande importância no cenário econômico mundial, estudos em cana-de-açúcar são cada vez mais importantes no sentido de prover informações que possam levar ao aumento de produtividade para suprir tanto a demanda interna quanto externa. A genômica em cana-de-açúcar é uma ciência engatinhando perto do conhecimento de espécies similares como sorgo, milho e arroz. O início dos estudos ocorreu com o projeto SUCEST e continua se expandindo nas atividades do projeto SUCEST-FUN e do sequenciamento do genoma da cana em andamento. No entanto, como sabido de outros organismos, o sequenciamento resolverá apenas parte de um problema maior, e será necessário começar a desvendar as complexas redes regulatórias da cana-de-açúcar, fornecendo dados de vias de regulação e conseqüências de sua alteração. O presente projeto insere-se neste contexto e visa analisar os dados gerados pelo projeto de sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar para estabelecer a arquitetura das redes regulatórias assim como identificar regiões regulatórias no genoma da cana. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SOUZA, GLAUCIA MENDES; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI; LEE, HAYAN; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES; HOTTA, CARLOS TAKESHI; GAIARSA, JONAS WEISSMANN; DINIZ, AUGUSTO LIMA; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS; FERREIRA, SAVIO DE SIQUEIRA; NISHIYAMA, MILTON YUTAKA; TEN-CATEN, FELIPE; RAGAGNIN, GEOVANI TOLFO; ANDRADE, PABLO DE MORAIS; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; NICASTRO, GIANLUCCA GONCALVES; PANDYA, RAVI; KIM, CHANGSOO; GUO, HUI; DURHAM, ALAN MITCHELL; CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO; ZHANG, JISEN; ZHANG, XINGTAN; ZHANG, QING; MING, RAY; SCHATZ, MICHAEL C.; DAVIDSON, BOB; PATERSON, ANDREW H.; HECKERMAN, DAVID. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GIGASCIENCE, v. 8, n. 12 DEC 2019. Citações Web of Science: 3.

FERREIRA, SAVIO SIQUEIRA; HOTTA, CARLOS TAKESHI; DE CARLI POELKING, VIVIANE GUZZO; COELHO LEITE, DEBORA CHAVES; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA; LOUREIRO, MARCELO EHLERS; PEREIRA BARBOSA, MARCIO HENRIQUE; CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO; SOUZA, GLAUCIA MENDES. Co-expression network analysis reveals transcription factors associated to cell wall biosynthesis in sugarcane. Plant Molecular Biology, v. 91, n. 1-2, p. 15-35, MAY 2016. Citações Web of Science: 21.