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Análise funcional e evolutiva do cromossomo b em Astyanax paranae (Characiformes, Characidae

Processo: 13/24367-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de março de 2014
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Fausto Foresti
Beneficiário:Duílio Mazzoni Zerbinato de Andrade Silva
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):15/14789-0 - Análise dos genomas de Astyanax paranae (Characiformes, Characidae) portadores de 0 e 2 Cromossomos B por sequenciamento de nova geração, BE.EP.DR
Assunto(s):Sequenciamento de nova geração   Peixes   Sequências repetitivas de ácido nucleico   Citogenética   Cromossomos B   Astyanax

Resumo

Muito recentemente, o poder do sequenciamento de nova geração (NGS) começou a ser aplicado à pesquisa de cromossomos supranumerários ou cromossomos B de diferentes organismos. Entretanto, tal tecnologia ainda não foi aplicada aos cromossomos B em peixes. Resultados não divulgados do Laboratório de Biologia e Genética de Peixes (IB/UNESP/Botucatu) revelam que uma população de Astyanax paranae do rio Capivara, bacia do Rio Tietê apresenta um cromossomo B metacêntrico grande que, quando submetido à técnica de FISH evidenciou que sequencias de DNAr 18S e de histona H1 estão presentes neste cromossomo. Considera-se, pois, a possibilidade da presença de DNA ribossômico e da histona H1 estar ligada à origem do cromossomo supranumerário nesta espécie. A identificação de uma disposição simétrica destas sequencias nos braços do cromossomo B reforça a hipótese de que sua origem seja decorrente da formação de um isocromossomo. Dessa forma, o objetivo do presente projeto envolve a investigação do conteúdo genômico total deste cromossomo B, bem como a identificação de regiões potencialmente funcionais, genes de cópia única, DNA repetitivo e marcadores moleculares B-específicos através do sequenciamento de nova geração, visando estudar a sua origem, função e evolução a partir dos cromossomos do complemento A. O presente projeto se insere no programa geral de estudos citogenéticos de peixes Neotropicais que vem sendo desenvolvido no Laboratório de Biologia e Genética de Peixes (IB/UNESP/Botucatu), visando a um melhor conhecimento da estrutura cromossômica das células eucariontes e em particular dos peixes.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SILVA, DUILIO M. Z. DE A.; UTSUNOMIA, RICARDO; RUIZ-RUANO, FRANCISCO J.; DANIEL, SANDRO NATAL; PORTO-FORESTI, FABIO; HASHIMOTO, DIOGO TERUO; OLIVEIRA, CLAUDIO; CAMACHO, JUAN PEDRO M.; FORESTI, FAUSTO. High-throughput analysis unveils a highly shared satellite DNA library among three species of fish genus Astyanax. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, OCT 5 2017. Citações Web of Science: 8.
SILVA, DUILIO M. Z. DE A.; UTSUNOMIA, RICARDO; RUIZ-RUANO, FRANCISCO J.; OLIVEIRA, CLAUDIO; FORESTI, FAUSTO. The complete mitochondrial genome sequence of Astyanax paranae (Teleostei: characiformes). MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, v. 1, p. 586-587, 2016. Citações Web of Science: 0.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
SILVA, Duílio Mazzoni Zerbinato de Andrade. Análise funcional e evolutiva do cromossomo B em Astyanax paranae (Characiformes, Characidae). 2018. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu)..

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