Estudo da expressão dos genes TET e níveis de hidroximetilação em meduloblastoma.

• Processo: 13/15125-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2014
• Data de Término da vigência: 11 de junho de 2017
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Saúde Materno-infantil
• Pesquisador responsável: Luiz Gonzaga Tone
• Beneficiário: Karina Bezerra Salomão Xavier
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 15/15231-3 - Regulação epigenética de retroelementos pelas enzimas TET em células precursoras neuronais, BE.EP.DR
• Assunto(s): Meduloblastoma Epigenômica Epigênese genética Oncologia pediátrica Metilação
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Enzimas TET | epigenética | Hidroximetilação | Meduloblastoma | metilação | Oncologia pediátrica

Resumo

Meduloblastoma (MB) origina-se no cerebelo e representa o tumor cerebral maligno mais comum na infância. MB é tradicionalmente subdividido em cinco grupos histológicos relacionados ao prognóstico: MB desmoplásico, nodular, clássico, anáplasico e anáplasico de células grandes. Nos últimos anos, análises de expressão gênica e mutações em MB, possibilitaram a classificação em quatro subgrupos moleculares: (1) WNT; (2) SHH; (3) hiperexpressão de MYC e (4) anormalidades genéticas inespecíficas. As alterações epigenéticas como a hipermetilação de supressores tumorais desempenham um papel importante no desenvolvimento do MB. A redução da hidroximetilação e da expressão dos genes TET foram relatadas em vários tumores. Sabe-se também que a desregulação na função das enzimas TET pode estar associada com mutações nos genes IDH1 e IDH2. Apesar disso, ainda não se sabe muito sobre o perfil de hidroximetilação e a expressão dos genes TET em MB. Considerando esses dados, o presente projeto tem como objetivo avaliar a expressão dos genes TET1, TET2, TET3, IDH1 e IDH2 (normal e mutante), nível global de hidroximetilação, e a presença de hidroximetilação e/ou metilação em genes envolvidos nas vias SHH, WNT, NOTCH e BMP em amostras de pacientes portadores de MB. Para a análise da expressão gênica será utilizada a técnica de PCR em tempo real (sondas TaqMan). Será realizado o sequenciamento das amostras para verificar mutações em IDH1 e IDH2. O nível global de hidroximetilação será avaliado por técnica de hibridização (dot-blot). Para verificar a presença de metilação e/ou hidroximetilação em genes nas vias será utilizada PCR em tempo real associada à imunoprecipitação de 5-mC e 5-hmC.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SALOMAO, KARINA BEZERRA; VEIGA CRUZEIRO, GUSTAVO ALENCASTRO; BONFIM-SILVA, RICARDO; GERON, LENISA; RAMALHO, FERNANDO; SAGGIORO, FABIANO PINTO; SERAFINI, LUCIANO NEDER; ANTUNES MORENO, DANIEL; DE PAULA QUEIROZ, ROSANE GOMES; AGUIAR, SIMONE DOS SANTOS; et al. Reduced hydroxymethylation characterizes medulloblastoma while TET and IDH genes are differentially expressed within molecular subgroups. JOURNAL OF NEURO-ONCOLOGY, v. 139, n. 1, p. 33-42, AUG 2018. (13/15125-3, 14/20341-0)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

XAVIER, Karina Bezerra Salomão. Estudo da expressão dos genes TETs e níveis de hidroximetilação em meduloblastoma. 2017. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (PCARP/BC) Ribeirão Preto.