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Elaboração de um pacote em r para uso em pesquisa de genética quantitativa

Processo: 14/01694-9
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de março de 2014
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Quantitativa
Pesquisador responsável:Gabriel Henrique Marroig Zambonato
Beneficiário:Diogo Amaral Reboucas Melo
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:11/14295-7 - Modularidade e suas consequências evolutivas, AP.TEM

Resumo

O Laboratório de Evolução de mamíferos conta com um repositório público, noqual são centralizados códigos de uso comum. Neste repositório temos rotinas deanálises estatísticas (como ajuste de modelos lineares, estimavas e comparaçãode matrizes de variância-covariância, detecção e validação de módulosvariacionais, geração de matrizes aleatórias, testes de rarefação, construçãode intervalos de confiança via bootstrap, entre outros), bem como modeloscomputacionais de simulação de populações biológicas e estimativas de estadosancestrais. Para que essas mesmas rotinas possam ser utilizadas amplamentepela comu- nidade científica, um processo de padronização maior deve seestabelecer, com a criação de testes de validação automatizados e documentaçãoclara, em inglês e português, permitindo, então, sua atualização contínua egarantindo sempre que os códigos estejam produzindo resultados corretos. Alémda produção de um pacote de funções ligadas a analise de dados em morfometriatradicional e geométrica, pretendemos também padronizar a armazenagem erepresentação de dados de morfometria no sistema R, facilitando a limpeza dedados, identificação e trata- mento de dados anômalos (outliers), criação devisualizações e compartilhamento de rotinas e dados entre pesquisadores.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
WOLF, JASON B.; HOWIE, JENNIFER A.; PARKINSON, KATIE; GRUENHEIT, NICOLE; MELO, DIOGO; ROZEN, DANIEL; THOMPSON, CHRISTOPHER R. L. Fitness Trade-offs Result in the Illusion of Social Success. Current Biology, v. 25, n. 8, p. 1086-1090, APR 20 2015. Citações Web of Science: 18.

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