Diversidade microbiana: a importância da exploração de novas fontes de biodiversidade

• Processo: 13/25505-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2014
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2016
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Itamar Soares de Melo
• Beneficiário: Danilo Tosta Souza
• Instituição Sede: Embrapa Meio-Ambiente. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Brasil). Jaguariúna , SP, Brasil
• Assunto(s): Ecologia microbiana Microbiota Metagenômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: holobionte | Ilhas Oceânicas | metagenômica | Microbioma | Ecologia Microbiana

Resumo

Dentre os ecossistemas brasileiros, alguns chamam atenção devido à particular combinação de condições ambientais únicas, que resultam na evolução de espécies capazes de colonizar restritamente estes hábitats. Entre esses ambientes, há um destaque em especial ao Arquipélago de São Pedro e São Paulo (ASPSP) localizado na região equatorial norte do Oceano Atlântico o qual dista cerca de 1.010 km da cidade de Natal - RN, a meio caminho entre o nordeste Brasileiro e o continente Africano. O ASPSP é constituído por cinco ilhas maiores e numerosos rochedos, sendo um dos lugares mais inóspitos do País. A formação geológica das ilhas é única em todo o mundo e se projeta para o mar com forte declive, sendo desprovidas de praias, vegetação e água potável. Apesar de apresentar condições adversas à vida na parte emersa, esse conjunto de ilhas é cercado de rica biodiversidade na parte submersa. Nesse cenário, destacam-se as esponjas marinhas, as quais são provavelmente os metazoários mais primitivos ainda existentes, e são um organismo excelente para o estudo das interações entre organismos superiores e procariotos. No seu meio ambiente, cerca de 40-60% da biomassa da esponja é composta por micro-organismos, o que permite utilizar as esponjas como uma fonte de amostras de comunidades microbianas aquáticas. Estes microbiomas apresentam uma variedade de micro-organismos, desde os organismos utilizados na dieta da esponja a bactérias residentes e simbiontes, constituindo um reservatório natural de diversidade genética e de metabólitos secundários com interesse biotecnológico. O ASPSP tem um apelo especial para exploração das interações entre esponjas e micro-organismos, pois possuem algumas espécies de esponjas de ocorrência exclusiva ainda pouco afetada pela ação antrópica. Esse fato, aliado ao desconhecimento completo dessas associações reforça o interesse de incentivar pesquisas na região. Neste sentido, este projeto tem por objetivo o estudo da diversidade genética das bactérias associadas a esponjas. A exploração irá incidir sobre esponjas com interesse ecológico e biotecnológico e irá revelar a diversidade molecular e as características funcionais do microbioma das esponjas.

Publicações científicas

(7)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BONONI, LAURA; TAKETANI, RODRIGO GOUVEA; SOUZA, DANILO TOSTA; MOITINHO, MARTA ALVES; KAVAMURA, VANESSA NESSNER; MELO, ITAMAR SOARES. Higher phylogenetic diversity prevents loss of functional diversity caused by successive drying and rewetting cycles. ANTONIE VAN LEEUWENHOEK INTERNATIONAL JOURNAL OF GENERAL AND MOLECULAR MICROBIOLOGY, v. 111, n. 7, p. 1033-1045, JUL 2018. (13/25505-8)

SILVA, LEONARDO JOSE; SOUZA, DANILO TOSTA; GENUARIO, DIEGO BONALDO; VARGAS HOYOS, HAROLD ALEXANDER; SANTOS, SUIKINAI NOBRE; ROSA, LUIZ HENRIQUE; ZUCCHI, TIAGO DOMINGUES; MELO, ITAMAR SOARES. Rhodococcus psychrotolerans sp nov., isolated from rhizosphere of Deschampsia antarctica. ANTONIE VAN LEEUWENHOEK INTERNATIONAL JOURNAL OF GENERAL AND MOLECULAR MICROBIOLOGY, v. 111, n. 4, p. 629-636, APR 2018. (13/25505-8, 14/26131-7)

SOUZA, DANILO TOSTA; PAULINO DA SILVA, FABIO SERGIO; DA SILVA, LEONARDO JOSE; CREVELIN, EDUARDO JOSE; BERALDO MORAES, LUIZ ALBERTO; ZUCCHI, TIAGO DOMINGUES; MELO, ITAMAR SOARES. Saccharopolyspora spongiae sp nov., a novel actinomycete isolated from the marine sponge Scopalina ruetzleri (Wiedenmayer, 1977). INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, v. 67, n. 6, p. 7-pg., 2017-06-01. (13/25505-8)

MOITINHO, MARTA A.; BONONI, LAURA; SOUZA, DANILO T.; MELO, ITAMAR S.; TAKETANI, RODRIGO G.. Bacterial Succession Decreases Network Complexity During Plant Material Decomposition in Mangroves. MICROBIAL ECOLOGY, v. 76, n. 4, p. 954-963, NOV 2018. (13/03158-4, 13/23470-2, 13/25505-8)

PAULINO SILVA, FABIO SERGIO; SOUZA, DANILO TOSTA; ZUCCHI, TIAGO DOMINGUES; PANSA, CAMILA CRISTIANE; DE FIGUEIREDO VASCONCELLOS, RAFAEL LEANDRO; CREVELIN, EDUARDO JOSE; BERALDO DE MORAES, LUIZ ALBERTO; MELO, ITAMAR SOARES. Streptomyces atlanticus sp nov., a novel actinomycete isolated from marine sponge Aplysina fulva (Pallas, 1766). ANTONIE VAN LEEUWENHOEK INTERNATIONAL JOURNAL OF GENERAL AND MOLECULAR MICROBIOLOGY, v. 109, n. 11, p. 1467-1474, NOV 2016. (13/25505-8)

SOUZA, DANILO TOSTA; PAULINO DA SILVA, FABIO SERGIO; DA SILVA, LEONARDO JOSE; CREVELIN, EDUARDO JOSE; BERALDO MORAES, LUIZ ALBERTO; ZUCCHI, TIAGO DOMINGUES; MELO, ITAMAR SOARES. Saccharopolyspora spongiae sp nov., a novel actinomycete isolated from the marine sponge Scopalina ruetzleri (Wiedenmayer, 1977). INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, v. 67, n. 6, p. 2019-2025, JUN 2017. (13/25505-8)

SOUZA, DANILO T.; GENUARIO, DIEGO B.; SILVA, FABIO SERGIO P.; PANSA, CAMILA C.; KAVAMURA, VANESSA N.; MORAES, FERNANDO C.; TAKETANI, RODRIGO G.; MELO, ITAMAR S.. Analysis of bacterial composition in marine sponges reveals the influence of host phylogeny and environment. FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, v. 93, n. 1, JAN 2016. (13/03158-4, 14/26131-7, 13/08144-1, 13/25505-8)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SOUZA, Danilo Tosta. Exploração da diversidade bacteriana de esponjas marinhas por abordagens dependente e independente de cultivo. 2016. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.