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Estudo de coexpressão de genes do cromossomo Y e genes autossômicos e sua relação com o transtorno do espectro autista (TEA)

Processo: 14/00041-1
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de abril de 2014
Vigência (Término): 31 de março de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Helena Paula Brentani
Beneficiário:Ana Carolina Tahira
Instituição Sede: Instituto de Psiquiatria Doutor Antonio Carlos Pacheco e Silva (IPq). Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP (HCFMUSP). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Transtorno autístico   Expressão gênica   Cromossomo Y
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:autismo | Cromossomo Y | expressão gênica | matrix de coexpressão | Biologia Molecular/Bioinformática

Resumo

O transtorno do espectro autista (TEA) é uma doença do neurodesenvolvimento com alta frequência na população e apresenta um amplo espectro de severidade e prejuízos. Interessantemente, há uma distorção na taxa de prevalência entre meninos e meninas (4:1). Muitas hipóteses focando o dimorfismo sexual foram criadas a fim de explicar esta prevalência, entretanto o exato mecanismo que consiga explicar este quadro ainda é desconhecido. Recentemente, estudos feitos em Drosophila melanogaster mostraram que um conjunto de genes autossomos ou no cromossomo X apresentou diferença de expressão nos experimentos de introgressão do cromossomo Y. Em humanos, esta variação de expressão de genes autossômicos/X por genes ou transcritos mapeados no cromossomo Y ainda é muito pouco explorada. Neste sentido, este projeto tem como foco estudar se mudanças na expressão de genes do cromossomo Y são acompanhadas pelos genes localizados em outros cromossomos utilizando como base a construção de matrizes de coexpressão (WGCNA, implementado no R) utilizando amostras de dados públicos de microarranjos de indivíduos do sexo masculino. Ainda, pretende-se verificar se esta coexpressão é diferente na comparação entre indivíduos autistas e normais. Junto a esta proposta, ainda pretende-se identificar genes ortólogos humanos em D. Melanogaster que mostraram diferença de expressão devido aos diferentes cromossomos Y e verificar se este conjunto de genes humanos está enriquecido com genes associados ao autismo. Esta abordagem poderia sugerir efeito do cromossomo Y no autismo, criando perspectivas para as possíveis funções de genes no cromossomo Y, sendo um trabalho importante para melhor compreensão dos mecanismos envolvidos no TEA.

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Publicações científicas (6)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
FELTRIN, ARTHUR SANT'ANNA; TAHIRA, ANA CAROLINA; SIMOES, SERGIO NERY; BRENTANI, HELENA; MARTINS, JR., DAVID CORREA. Assessment of complementarity of WGCNA and NERI results for identification of modules associated to schizophrenia spectrum disorders. PLoS One, v. 14, n. 1, . (11/04956-6, 11/50761-2, 14/00041-1, 14/10488-3, 15/01587-0)
MASCHIETTO, MARIANA; TAHIRA, ANA C.; PUGA, RENATO; LIMA, LEANDRO; MARIANI, DANIEL; PAULSEN, BRUNA DA SILVEIRA; BELMONTE-DE-ABREU, PAULO; VIEIRA, HENRIQUE; KREPISCHI, ANA C. V.; CARRARO, DIRCE M.; et al. Co-expression network of neural-differentiation genes shows specific pattern in schizophrenia. BMC MEDICAL GENOMICS, v. 8, . (14/00041-1)
CAMILO, CAROLINE; MASCHIETTO, MARIANA; VIEIRA, HENRIQUE C.; TAHIRA, ANA C.; GOUVEIA, GISELE R.; FEIO DOS SANTOS, ANA C.; NEGRAO, ANDRE B.; RIBEIRO, MARCELO; LARANJEIRA, RONALDO; VALLADA, HOMERO; et al. Genome-wide DNA methylation profile in the peripheral blood of cocaine and crack dependents. Revista Brasileira de Psiquiatria, v. 41, n. 6, p. 485-493, . (13/00659-2, 15/06281-7, 14/00041-1)
TAHIRA, ANA CAROLINA; BARBOSA, ANDRE ROCHA; FELTRIN, ARTHUR SANT'ANNA; GASTALDI, VINICIUS DAGUANO; CALEGARI DE TOLEDO, VICTOR HUGO; DE CARVALHO PEREIRA, JOSE GERALDO; GARCIA LISBOA, BIANCA CRISTINA; DE SOUZA REIS, VIVIANE NERI; FEIO DOS SANTOS, ANA CECILIA; MASCHIETTO, MARIANA; et al. Putative contributions of the sex chromosome proteins SOX3 and SRY to neurodevelopmental disorders. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART B-NEUROPSYCHIATRIC GENETICS, v. 180, n. 6, SI, p. 390-414, . (11/14658-2, 14/10488-3, 11/04956-6, 15/06281-7, 14/00041-1, 14/00591-1)
TAHIRA, ANA; MARQUES, FERNANDA; LISBOA, BIANCA; FELTRIN, ARTHUR; BARBOSA, ANDRE; DE OLIVEIRA, KATIA CRISTINA; DE BRAGANCA PEREIRA, CARLOS ALBERTO; LEITE, RENATA; GRINBERG, LEA; SUEMOTO, CLAUDIA; et al. Are the 50's, the transition decade, in choroid plexus aging?. GEROSCIENCE, v. 43, n. 1, SI, . (14/10488-3, 14/00591-1, 14/00041-1, 11/14658-2)
NERI DE SOUZA REIS, VIVIANE; TAHIRA, ANA CAROLINA; DAGUANO GASTALDI, VINICIUS; MARI, PAULA; PORTOLESE, JOANA; FEIO DOS SANTOS, ANA CECILIA; LISBOA, BIANCA; MARI, JAIR; CAETANO, SHEILA C.; BRUNONI, DECIO; et al. Environmental Influences Measured by Epigenetic Clock and Vulnerability Components at Birth Impact Clinical ASD Heterogeneity. GENES, v. 12, n. 9, . (14/00041-1, 12/51584-0, 14/00591-1, 11/14658-2)

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