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Caracterização, distribuição e estudo da atividade de elementos transponíveis em Puccinia psidii Winter, agente causal de ferrugem em Eucalyptus spp

Processo: 14/04803-3
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de maio de 2014
Vigência (Término): 31 de julho de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Maria Carolina Quecine Verdi
Beneficiário:Sarina Tsui
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Assunto(s):Eucalipto   Genômica   Puccinia psidii

Resumo

O setor florestal brasileiro destina 70% da área à cultura do eucalipto, em 2012 o setor arrecadou o valor de BRL 7,6 bilhões de tributos além de gerar de mais de 4,3 milhões de empregos. Entretanto, essa espécie florestal está sujeita ao ataque de vários patógenos ao longo de seu ciclo de desenvolvimento, reduzindo sua produtividade. Destaca-se a ferrugem, doença causada pelo fungo Puccinia psidii Winter, cujo conhecimento da biologia é escasso, apesar de sua importância. Estudos relacionados à genômica de P. psidii são necessários para o melhor entendimento da genética e mecanismo de patogenicidade. Os elementos transponíveis são sequências de DNA com a capacidade de migrar e influenciar a organização, integridade e evolução do genoma hospedeiro, além disso, estão relacionados à regulação da expressão de genes em diferentes espécies. Devido ao importante papel que estes elementos exercem em genomas de fungos, o presente estudo se baseará em uma análise de elementos transponíveis de P. psidii, por meio da anotação funcional de sequências do seu genoma parcialmente sequenciado. Será feita a deteccão, classificação e quantificação das principais subfamílias e análise de mecanismos de seu possível silenciamento. As principais subfamílias serão enfatizadas para tentar entender os possíveis processos influenciados pela atividade destes elementos. Finalmente por meio da técnica de TAIL-PCR (Thermal Asymmetric Interlaced PCR) as sequências que flanqueiam os principais elementos transponíveis em atividade no genoma de P. psidii serão identificadas, visando assim, o melhor entendimento da evolução do genoma do patógeno e então futuramente, a complexa interação planta-patógeno para o desenvolvimento de novas estratégias de controle.

Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
TSUI, Sarina. Estudo de elementos transponíveis em Puccinia psidii Winter, agente causal de ferrugem em Eucalyptus spp.. 2015. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Piracicaba.

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