Busca avançada
Ano de início
Entree

Caracterização Fenotipica de cepas deletérias de Neurospora crassa crescidas em Avicel e bagaço de cana-de-açúcar

Processo: 14/10351-8
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de setembro de 2014
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Fábio Márcio Squina
Beneficiário:Cristiane Akemi Uchima
Supervisor no Exterior: N. Louise Glass
Instituição-sede: Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações (Brasil). Campinas , SP, Brasil
Local de pesquisa : Energy Biosciences Institute, Berkeley (EBI), Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:12/19040-0 - Caracterização da expressão gênica do fungo Neurospora crassa na desconstrução do bagaço de cana de açúcar, BP.PD
Assunto(s):Neurospora crassa

Resumo

A produção de bioetanol é uma opção atraente para diminuir o uso de recursos não renováveis provenientes do petróleo. O aumento da produção de bioetanol brasileiro pode ser advindo do bagaço de cana-de-açúcar, que é um resíduo agrícola sustentável e adequado para ser convertido em biocombustível. A recalcitrância da parede vegetal pode ser contornada com o uso de pré-tratamentos químicos ou físicos juntamente com a utilização de coquetéis enzimáticos. Na natureza, o fungo filamentoso Neurospora crassa degrada de forma eficiente a biomassa da planta através da secreção de uma ampla variedade de enzimas lignocelulolíticas. Assim sendo, o principal objetivo deste projeto de pesquisa de pós-doutorado é de caracterizar e comparar o secretoma e a expressão gênica de N. crassa em resposta ao crescimento em celulose (Avicel) e bagaço de cana-de-açúcar, como uma tentativa de compreender os mecanismos moleculares utilizados por este fungo na degradação da parede celular da planta. Até agora, o secretoma deste fungo crescido em Avicel, bagaço de cana in natura, bagaço de cana pré-tratado com ácido fosfórico, lignina e sacarose foram densamente analisados por ensaios bioquímicos e UPLC-LTQ-Orbitrap MS/MS. Além disso, com a utilização destes mesmos substratos, foi realizada também a análise do transcriptoma de N. crassa usando a tecnologia do sequenciamento de nova geração (RNA-seq). O objetivo deste estágio de pós-doutorado (BEPE-PD) no Instituto de Biociências de Energia (EBI), na Califórnia, EUA, é analisar o fenótipo das cepas contendo deleção em genes que codificam proteínas de funções conhecidas ou desconhecidas identificadas em nossos estudos de proteômica e transcriptômica, que por sua vez facilitará o entendimento de suas funções na desconstrução da biomassa da planta. A compreensão de como este organismo modelo responde a substratos lignocelulósicos pode contribuir substancialmente para o desenvolvimento de coquetéis enzimáticos mais baratos ou a criação de cepas hiper produtoras de enzimas lignocelulolíticas. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DE VRIES, RONALD P.; RILEY, ROBERT; WIEBENGA, AD; AGUILAR-OSORIO, GUILLERMO; AMILLIS, SOTIRIS; UCHIMA, CRISTIANE AKEMI; ANDERLUH, GREGOR; ASADOLLAHI, MOJTABA; ASKIN, MARION; BARRY, KERRIE; BATTAGLIA, EVY; BAYRAM, OZGUR; BENOCCI, TIZIANO; BRAUS-STROMEYER, SUSANNA A.; CALDANA, CAMILA; CANOVAS, DAVID; CERQUEIRA, GUSTAVO C.; CHEN, FUSHENG; CHEN, WANPING; CHOI, CINDY; CLUM, ALICIA; CORREA DOS SANTOS, RENATO AUGUSTO; DE LIMA DAMASIO, ANDRE RICARDO; DIALLINAS, GEORGE; EMRI, TAMAS; FEKETE, ERZSEBET; FLIPPHI, MICHEL; FREYBERG, SUSANNE; GALLO, ANTONIA; GOURNAS, CHRISTOS; HABGOOD, ROB; HAINAUT, MATTHIEU; LAURA HARISPE, MARIA; HENRISSAT, BERNARD; HILDEN, KRISTIINA S.; HOPE, RYAN; HOSSAIN, ABEER; KARABIKA, EUGENIA; KARAFFA, LEVENTE; KARANYI, ZSOLT; KRASEVEC, NADA; KUO, ALAN; KUSCH, HARALD; LABUTTI, KURT; LAGENDIJK, ELLEN L.; LAPIDUS, ALLA; LEVASSEUR, ANTHONY; LINDQUIST, ERIKA; LIPZEN, ANNA; LOGRIECO, ANTONIO F.; MACCABE, ANDREW; MAKELA, MIIA R.; MALAVAZI, IRAN; MELIN, PETTER; MEYER, VERA; MIELNICHUK, NATALIA; MISKEI, MARTON; MOLNAR, AKOS P.; MULE, GIUSEPPINA; NGAN, CHEW YEE; OREJAS, MARGARITA; OROSZ, ERZSEBET; OUEDRAOGO, JEAN PAUL; OVERKAMP, KARIN M.; PARK, HEE-SOO; PERRONE, GIANCARLO; PIUMI, FRANCOIS; PUNT, PETER J.; RAM, ARTHUR F. J.; RAMON, ANA; RAUSCHER, STEFAN; RECORD, ERIC; RIANO-PACHON, DIEGO MAURICIO; ROBERT, VINCENT; ROEHRIG, JULIAN; RULLER, ROBERTO; SALAMOV, ASAF; SALIH, NADHIRA S.; SAMSON, ROB A.; SANDOR, ERZSEBET; SANGUINETTI, MANUEL; SCHUTZE, TABEA; SEPCIC, KRISTINA; SHELEST, EKATERINA; SHERLOCK, GAVIN; SOPHIANOPOULOU, VICKY; SQUINA, FABIOM.; SUN, HUI; SUSCA, ANTONIA; TODD, RICHARD B.; TSANG, ADRIAN; UNKLES, SHIELA E.; VAN DE WIELE, NATHALIE; VAN ROSSEN-UFFINK, DIANA; DE CASTRO OLIVEIRA, JULIANA VELASCO; VESTH, TAMMI C.; VISSER, JAAP; YU, JAE-HYUK; ZHOU, MIAOMIAO; ANDERSEN, MIKAEL R.; ARCHER, DAVID B.; BAKER, SCOTT E.; BENOIT, ISABELLE; BRAKHAGE, AXEL A.; BRAUS, GERHARD H.; FISCHER, REINHARD; FRISVAD, JENS C.; GOLDMAN, GUSTAVO H.; HOUBRAKEN, JOS; OAKLEY, BERL; POCSI, ISTVAN; SCAZZOCCHIO, CLAUDIO; SEIBOTH, BERNHARD; VANKUYK, PATRICIA A.; WORTMAN, JENNIFER; DYER, PAUL S.; GRIGORIEV, IGOR V. Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus. Genome Biology, v. 18, FEB 14 2017. Citações Web of Science: 105.
FRANCO CAIRO, JOAO P. L.; CARAZZOLLE, MARCELO F.; LEONARDO, FLAVIA C.; MOFATTO, LUCIANA S.; BRENELLI, LIVIA B.; GONCALVES, THIAGO A.; UCHIMA, CRISTIANE A.; DOMINGUES, ROMANIA R.; ALVAREZ, THABATA M.; TRAMONTINA, ROBSON; VIDAL, RAMON O.; COSTA, FERNANDO F.; COSTA-LEONARDO, ANA M.; PAES LEME, ADRIANA F.; PEREIRA, GONCALO A. G.; SQUINA, FABIO M. Expanding the Knowledge on Lignocellulolytic and Redox Enzymes of Worker and Soldier Castes from the Lower Termite Coptotermes gestroi. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 7, OCT 13 2016. Citações Web of Science: 8.

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas escrevendo para: cdi@fapesp.br.