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Diversidade genética intra-hospedeiro do vírus da dengue tipo 4 no município de Guarujá, Estado de São Paulo

Processo: 13/25434-3
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de julho de 2014
Vigência (Término): 30 de junho de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia
Pesquisador responsável:Paolo Marinho de Andrade Zanotto
Beneficiário:Ayda Susana Ortiz Baez
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Filogenia   Diversidade genética   Variação genética   Sequenciamento   Epidemiologia molecular   Evolução molecular   Dengue

Resumo

A caracterização da variabilidade genética intra-hospedeiro no vírus da dengue (DENV) é fundamental para a compreensão de sua evolução e dinâmica populacional no contexto atual, como um importante patógeno humano. A diversidade viral acumulada em hospedeiros infectados influencia diretamente outros aspectos como a patogênese, transmissão e imunidade do hospedeiro. Apesar de existirem vários estudos sobre a diversidade genética intra-hospedeiro em dengue (1 ,5), até o presente momento, poucos dados foram relatados para DENV-4. O ressurgimento e disseminação desse sorotipo foi associado com a sua co-circulação e o substituição dos sorotipos 1, 2 e 3 durante os recentes surtos no município do Guarujá, no estado de São Paulo, (Villabona-Arenas et al., PLoS NTD na Imprensa). Com base neste quadro epidemiológico, procuramos identificar a variação genética intra-hospedeiro do DENV-4 em amostras coletadas durante o surto de 2013, usando tecnologias de sequenciamento de nova geração. Nós estimaremos o nível de variabilidade e história evolutiva desses vírus, em resposta a pressões seletivas impostas por uma população urbana previamente exposta ao outros três sorotipos de dengue. Este estudo também será o primeiro trabalho a investigar a diversidade intra-hospedeiro do DENV-4. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CUNHA, MARIELTON DOS PASSOS; ORTIZ-BAEZ, AYDA SUSANA; DE MELO FREIRE, CAIO CESAR; DE ANDRADE ZANOTTO, PAOLO MARINHO. Codon adaptation biases among sylvatic and urban genotypes of Dengue virus type 2. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 64, p. 207-211, . (16/08204-2, 13/25434-3)
ORTIZ-BAEZ, AYDA SUSANA; SILVA, DANIELLE FERREIRA; FERREIRA, DANIEL; ZANOTTO, PAOLO M.. First Genome Sequences of Dengue Virus (DENV) Strains Isolated during the First DENV-4 Outbreak in Sao Paulo, Brazil. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 5, n. 28, . (13/25434-3)
CUNHA, MARIELTON DOS PASSOS; DUARTE-NETO, AMARO NUNES; POUR, SHAHAB ZAKI; ORTIZ-BAEZ, AYDA SUSANA; CERNY, JIRI; DE SOUZA PEREIRA, BARBARA BRITO; BRACONI, CARLA TORRES; HO, YEH-LI; PERONDI, BEATRIZ; SZTAJNBOK, JAQUES; et al. Origin of the Sao Paulo Yellow Fever epidemic of 2017-2018 revealed through molecular epidemiological analysis of fatal cases. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, . (17/23281-6, 13/25434-3, 13/21728-2, 16/08204-2)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
BAEZ, Ayda Susana Ortiz. Diversidade intra-hospedeiro do vírus da dengue tipo-4 circulando em Guarujá, São Paulo.. 2016. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI) São Paulo.

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