Caracterização molecular de híbridos heteróticos das linhagens Red Stirling e Chitralada da Tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus)

• Processo: 14/03062-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de julho de 2014
• Vigência (Término): 31 de agosto de 2017
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
• Pesquisador responsável: Danillo Pinhal
• Beneficiário: Marcos Edgar Herkenhoff
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 15/06661-4 - Análise do proteoma utilizando eletroforese de gel de duas dimensões em híbridos heteróticos entre as linhagens Red Stirling e Chitralada da Tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus), BE.EP.DR
• Assunto(s): Miostatina Expressão gênica Polimorfismo genético Tilápia-do-Nilo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: expressão gênica | insulin-like growth factor | Maldi-Tof | Miostatina | miRNA | Polimorfismo gênico | Genética Melhoramento Animal de Peixes

Resumo

A tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) é uma das espécies de peixes de maior importância econômica no Brasil e no mundo. Híbridos da espécie com heterose ou vigor híbrido foram produzidos a partir do cruzamento das linhagens puras Chitralada e Red Stirling. Esse cruzamento possibilitou a combinação de características zootécnicas de interesse, como o rápido crescimento e o maior ganho de peso da Chitralada, à carne de coloração rosada da Red Stirling. Embora essa estratégia de melhoramento clássico seja eficiente na geração dos híbridos, pouco se conhece a respeito dos mecanismos moleculares pelos quais a heterose afeta a expressão gênica e quais vias biológicas estão sendo moduladas para produzir os efeitos fenotípicos benéficos resultantes. Nesse sentido alguns genes (IGF-1, IGF-2, IGF-3 e miostatina) têm sido diretamente correlacionados ao ganho de peso e a outras características de importância na produção animal. Além disso, recentemente uma classe de RNAs não-codificadores, os microRNAs (miRNAs), surgiram como moléculas chave na regulação da expressão gênica. No presente projeto propõe-se investigar o fenômeno da heterose pela análise dos polimorfismos, perfis de expressão e produtos protéicos dos genes candidatos IGF-1, IGF-2, IGF-3 e miostatina dos híbridos do cruzamento Chitralada e Red Stirling utilizando sequenciamento de Sanger e PCR em tempo real (qPCR). Objetiva-se também caracterizar o transcriptoma de miRNAs por RNA-Seq e avaliar a composição protéica do tecido muscular por MALDI-TOF. Como perspectiva espera-se determinar os mecanismos pelos quais genes e reguladores associados à heterose atuam, gerando-se dados com potencial aplicabilidade futura no setor produtivo. Destaca-se que a presente proposta está vinculada a um amplo projeto para caracterização de miRNAs, atualmente em desenvolvimento (Auxílio Regular à Pesquisa FAPESP - 2012/15589-7). (AU)

Publicações científicas

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

HERKENHOFF, MARCOS EDGAR; BOVOLENTA, LUIZ A.; BROEDEL, OLIVER; DOS SANTOS, LUCILENE D.; DE OLIVEIRA, ARTHUR C.; CHUFFA, LUIZ G. A.; RIBEIRO, AMANDA DE O.; LUPI, LUIZ A.; DIAS, MARCO A. D.; HILSDORF, ALEXANDRE W. S.; et al. ariant expression signatures of microRNAs and protein related to growth in a crossbreed between two strains of Nile tilapia (Oreochromis niloticus. Genomics, v. 113, n. 6, p. 4303-4312, NOV 2021. (14/03062-0, 11/23752-2)

RIBEIRO, AMANDA OLIVEIRA; DE OLIVEIRA, ARTHUR CASULLI; COSTA, JULIANA MARA; NACHTIGALL, PEDRO GABRIEL; HERKENHOFF, MARCOS EDGAR; CAMPOS, VINICIUS FARIAS; DELELLA, FLAVIA KARINA; PINHAL, DANILLO. MicroRNA roles in regeneration: Multiple lessons from zebrafish. DEVELOPMENTAL DYNAMICS, SEP 2021. (14/03062-0, 13/06864-7, 18/14348-2, 18/05484-0, 19/15494-5)

HERKENHOFF, MARCOS EDGAR; BAJAY, MIKLOS MAXIMILIANO; COSTAMILAN, CARLOS ANDRE DA VEIGA LIMA-ROSA. Genetic Structure and Biodiversity in Wild Centropomus parallelus and in Wild and Recently Domesticated Centropomus undecimallis Populations. LIFE-BASEL, v. 13, n. 7, p. 10-pg., 2023-07-01. (14/03062-0)

OLIVEIRA, ARTHUR C.; BOVOLENTA, LUIZ A.; NACHTIGALL, PEDRO G.; HERKENHOFF, MARCOS E.; LEMKE, NEY; PINHAL, DANILLO. Combining Results from Distinct MicroRNA Target Prediction Tools Enhances the Performance of Analyses. FRONTIERS IN GENETICS, v. 8, MAY 16 2017. (14/03062-0, 13/06864-7, 12/13450-1, 15/19176-7)

HERKENHOFF, M. E.; RIBEIRO, A. O.; COSTA, J. M.; OLIVEIRA, A. C.; DIAS, M. A. D.; REIS NETO, R. V.; HILSDORF, A. W. S.; PINHAL, D.. Expression profiles of growth-related genes in two Nile tilapia strains and their crossbred provide insights into introgressive breeding effects. ANIMAL GENETICS, v. 51, n. 4, MAY 2020. (14/03062-0, 12/15589-7)

HERKENHOFF, MARCOS E.; OLIVEIRA, ARTHUR C.; NACHTIGALL, PEDRO G.; COSTA, JULIANA M.; CAMPOS, VINICIUS F.; HILSDORF, ALEXANDRE W. S.; PINHAL, DANILLO. Fishing Into the MicroRNA Transcriptome. FRONTIERS IN GENETICS, v. 9, MAR 19 2018. (14/03062-0, 13/06864-7, 12/15589-7)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

HERKENHOFF, Marcos Edgar. Caracterização molecular de híbridos heteróticos das linhagens Red Stirling e Chitralada da tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus). 2017. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências. Botucatu Botucatu.