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Estudos de genética de sistemas de medidas de confinamento usando painel de SNP super-denso

Processo: 14/14121-7
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 15 de setembro de 2014
Vigência (Término): 14 de setembro de 2015
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:José Bento Sterman Ferraz
Beneficiário:Miguel Henrique de Almeida Santana
Supervisor no Exterior: Haja Kadarmideen
Instituição-sede: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA). Universidade de São Paulo (USP). Pirassununga , SP, Brasil
Local de pesquisa : University of Copenhagen, Dinamarca  
Vinculado à bolsa:13/20571-2 - Genômica funcional da ingestão e eficiência alimentar de bovinos da raça Nelore, BP.PD
Assunto(s):Bovinos de corte   Carne bovina   Carcaça   Genômica   Marcador molecular   Eficiência alimentar

Resumo

A indústria de carne bovina é um dos principais destaques do agronegócio brasileiro, e tem grande importância no mercado mundial, já que o Brasil tem um dos maiores rebanhos de gado do mundo, com cerca de 200 milhões de cabeças. Este rebanho é composto predominantemente de animais Bos indicus, cujo gado Nelore e seus cruzamentos compõe cerca de 90% desse montante. Devido à sua importância, o interesse econômico e aumento da produção, são necessárias melhorias na eficiência produtiva, como a seleção de animais geneticamente superiores e uso de estratégias de manejo, como a terminação em confinamento. A ingestão de alimentos, eficiência alimentar, características de carcaça e velocidade de crescimento são importantes medidas de bovinos de corte em confinamento. O uso de informações de polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) podem identificar de genes ou regiões genômicas responsáveis pelos fenótipos, tais como características de carcaça, crescimento e eficiência alimentar. Isso é realizado por estudos de associação de amplo genoma (GWAS) que comparam as centenas de milhares de SNPs com essas características de interesse. No entanto, os painéis de marcadores foram projetados para bovinos Bos taurus, e quando eles são usados em Bos indicus (Nelore) podem ser menos informativos, especialmente por boa parte dos SNPs não serem polimórficos ou com baixa frequência de um dos alelos. Uma possível estratégia para contornar este problema seria aumentar a densidade dos painéis a serem utilizados em GWAS para Bos indicus. O objetivo deste projeto é realizar a GWAS usando um painel super-denso, com cerca de 1,25 milhões de SNPs, explorando regiões genômicas, desequilíbrio de ligação e regiões com variações no número de cópias (CNVs) para características de carcaça, desempenho, consumo e eficiência alimentar em cerca de 900 bovinos Nelore. Além disso, esses resultados serão analisados a partir da perspectiva da genética de sistemas para o ingestão/eficiência alimentar e ganho de peso; e também para as características de carcaça. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DE ALMEIDA SANTANA, MIGUEL HENRIQUE; OLIVEIRA JUNIOR, GERSON ANTONIO; MELLO CESAR, ALINE SILVA; FREUA, MATEUS CASTELANI; GOMES, RODRIGO DA COSTA; DA LUZ E SILVA, SAULO; LEME, PAULO ROBERTO; FUKUMASU, HEIDGE; CARVALHO, MINOS ESPERANDIO; VENTURA, RICARDO VIEIRA; COUTINHO, LUIZ LEHMANN; KADARMIDEEN, HAJA N.; STERMAN FERRAZ, JOSE BENTO. Copy number variations and genome-wide associations reveal putative genes and metabolic pathways involved with the feed conversion ratio in beef cattle. JOURNAL OF APPLIED GENETICS, v. 57, n. 4, p. 495-504, NOV 2016. Citações Web of Science: 20.
SANTANA, M. H. A.; FREUA, M. C.; DO, D. N.; VENTURA, R. V.; KADARMIDEEN, H. N.; FERRAZ, J. B. S. Systems genetics and genome-wide association approaches for analysis of feed intake, feed efficiency, and performance in beef cattle. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 4 2016. Citações Web of Science: 3.
SANTANA, M. H. A.; VENTURA, R. V.; UTSUNOMIYA, Y. T.; NEVES, H. H. R.; ALEXANDRE, P. A.; OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; GOMES, R. C.; BONIN, M. N.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, J. F.; SILVA, S. L.; FUKUMASU, H.; LEME, P. R.; FERRAZ, J. B. S. A genomewide association mapping study using ultrasound-scanned information identifies potential genomic regions and candidate genes affecting carcass traits in Nellore cattle. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, v. 132, n. 6, p. 420-427, DEC 2015. Citações Web of Science: 9.

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